RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560185.1

AKAP13-215, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 2

Gene AKAP13, Length 611 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-215	ENST00000560185	PKP2	Q99959	881 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	FZR1	Q9UM11	496 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	ABCA4	P78363	2273 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	TACC2	O95359	2948 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	PDZD2	O15018	2839 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	FAM183A	A6NL82	134 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185		M0R233	179 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	BAG2	O95816	211 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	IGHV4-39	P01824	125 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	SPARC	P09486	303 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	GSTT1	P30711	240 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	RGS6	P49758	472 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	ENTPD1	P49961	510 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	ZSCAN26	Q16670	478 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	SNX33	Q8WV41	574 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	PTP4A1	Q93096	173 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	COQ7	Q99807	217 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	S100A14	Q9HCY8	104 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AKAP13-215	ENST00000560185	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		13.71	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	CREBBP	Q92793	2442 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	SPG11	Q96JI7	2443 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	POLQ	O75417	2590 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185		F5H5K5	113 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	GLCE	O94923	617 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF250	P15622	560 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	GGT2	P36268	569 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	TPTE	P56180	551 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	PPP1CB	P62140	327 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	HIST1H3A	P68431	136 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	SHF	Q7M4L6	423 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	CPO	Q8IVL8	374 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF511	Q8NB15	262 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	SPTSSA	Q969W0	71 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	ATF6B	Q99941	703 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	MED20	Q9H944	212 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	WDR76	Q9H967	626 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	MAST4	O15021	2626 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	TMEM129	A0AVI4	362 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	PLSCR5	A0PG75	271 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185		H3BNX3	289 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	PRODH	O43272	600 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	NDUFS7	O75251	213 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	CSF3	P09919	207 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	CLU	P10909	449 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	LIPA	P38571	399 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	WNT5A	P41221	380 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	SLC15A1	P46059	708 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	RAD23A	P54725	363 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	TEX30	Q5JUR7	227 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	LRP11	Q86VZ4	500 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	INTS14	Q96SY0	518 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	CIB1	Q99828	191 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	CENPM	Q9NSP4	180 aa		13.69	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185		J3QW42	95 aa		13.68	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	ICMT	O60725	284 aa		13.68	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	CLPTM1	O96005	669 aa		13.68	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	NGF	P01138	241 aa		13.68	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	FOSL1	P15407	271 aa		13.68	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	ALDH3B1	P43353	468 aa		13.68	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	ERVS71-1	P61550	626 aa		13.68	□□□□□ -0.22
AKAP13-215	ENST00000560185	MALL	Q13021	153 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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