RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 AGAP20933 346 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CALCRP30988 508 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 GGT5P36269 586 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ETV6P41212 452 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 HTR5AP47898 357 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CCL11P51671 97 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 RPS18P62269 152 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 LGSNQ5TDP6 509 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CYS1Q717R9 158 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ZNF546Q86UE3 836 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CALHM1Q8IU99 346 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 FUNDC1Q8IVP5 155 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 MMP21Q8N119 569 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ATG4AQ8WYN0 398 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SCAMP4Q969E2 229 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ULK4Q96C45 1275 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 COL21A1Q96P44 957 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ELOVL6Q9H5J4 265 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 TMEM38AQ9H6F2 299 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SNX12Q9UMY4 172 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 KLK4Q9Y5K2 254 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 FBN3Q75N90 2809 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SPG11Q96JI7 2443 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 MYO7BQ6PIF6 2116 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ANKRD12Q6UB98 2062 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 M0R143 59 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 UBDO15205 165 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 GYG2O15488 501 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 UPK1BO75841 260 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SHBGP04278 402 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SERPIND1P05546 499 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CELA2AP08217 269 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ANXA3P12429 323 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SERPINA2P20848 420 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 MALP21145 153 aa6.93□□□□□ -1.3
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LMO3-212ENST00000535535 MAP2K4P45985 399 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 GPR1P46091 355 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 PPOXP50336 477 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 DLX5P56178 289 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 LSM6P62312 80 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 HERV-K104P63124 156 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SHFQ7M4L6 423 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SSX7Q7RTT5 188 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CRLF3Q8IUI8 442 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 STPG2Q8N412 459 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 RHEBL1Q8TAI7 183 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 DDB2Q92466 427 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 COX14Q96I36 57 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 HYLS1Q96M11 299 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 Q96MT0 163 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SORT1Q99523 831 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 NUDT9Q9BW91 350 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 GPR173Q9NS66 373 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 RLIMQ9NVW2 624 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SEC14L3Q9UDX4 400 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.93□□□□□ -1.3
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