RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531857.1

PKP3-208, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 4

Gene PKP3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-208ENST00000531857 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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PKP3-208ENST00000531857 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 SLC25A40Q8TBP6 338 aa14.64□□□□□ -0.07
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PKP3-208ENST00000531857 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 HIST1H2ACQ93077 130 aa14.64□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 POM121L2Q96KW2 1035 aa14.64□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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PKP3-208ENST00000531857 M0QX08 132 aa14.63□□□□□ -0.07
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PKP3-208ENST00000531857 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa14.62□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
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PKP3-208ENST00000531857 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.61□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.61□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 OAZ3Q9UMX2 235 aa14.61□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 NPTNQ9Y639 398 aa14.61□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 VWFP04275 2813 aa14.61□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 MCIDASD6RGH6 385 aa14.6□□□□□ -0.07
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