RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520746.1

HDAC2-208, Transcript of histone deacetylase 2, human

TSL 3

Gene HDAC2, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC2-208	ENST00000520746	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	CENPU	Q71F23	418 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	IPMK	Q8NFU5	416 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	OR2L5	Q8NG80	312 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	NRGN	Q92686	78 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	LRRC45	Q96CN5	670 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	C16orf74	Q96GX8	76 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	TSGA13	Q96PP4	275 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	LYSMD1	Q96S90	227 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	COPS8	Q99627	209 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	NRTN	Q99748	197 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	TRABD	Q9H4I3	376 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	FAM60A	Q9NP50	221 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	IL26	Q9NPH9	171 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	EURL	Q9NYK6	297 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	C3orf18	Q9UK00	162 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	RNF6	Q9Y252	685 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	MEMO1	Q9Y316	297 aa		2.56	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746		A0A0J9YY10	115 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746		H7C0C1	242 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	SDHD	O14521	159 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	LANCL1	O43813	399 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	GPX5	O75715	221 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	OR4F21	O95013	312 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	AGT	P01019	485 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	IGHV3-23	P01764	117 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	RPN2	P04844	631 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	SERPINA7	P05543	415 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	GZMA	P12544	262 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	TNNI3	P19429	210 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	MAG	P20916	626 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	VDAC1	P21796	283 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	KDELR1	P24390	212 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	ATP5O	P48047	213 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	CD151	P48509	253 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	RELN	P78509	3460 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	ST3GAL3	Q11203	375 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	IHH	Q14623	411 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	MESD	Q14696	234 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	KDELC1	Q6UW63	502 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	ARSK	Q6UWY0	536 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746		Q8N7P7	452 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	LINC01006	Q8NI28	216 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	M1AP	Q8TC57	530 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	ELMO1	Q92556	727 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	MARC2	Q969Z3	335 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	RNF157	Q96PX1	679 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	UCK2	Q9BZX2	261 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	EXO5	Q9H790	373 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	WDR54	Q9H977	334 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		2.55	□□□□□ -2
HDAC2-208	ENST00000520746	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2

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