RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482195.5

DDX39B-220, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 1,232 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-220ENST00000482195 FOXB2Q5VYV0 432 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 IGFN1Q86VF2 1251 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 NKAIN4Q8IVV8 208 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 SLC30A8Q8IWU4 369 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 OR5AS1Q8N127 324 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 ZNF283Q8N7M2 679 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 NPEPL1Q8NDH3 523 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 TMEM239Q8WW34 195 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 SAMD8Q96LT4 415 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 OR2V2Q96R30 315 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 SEPHS2Q99611 448 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 CGREF1Q99674 301 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 ZNF426Q9BUY5 554 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 ALG12Q9BV10 488 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 SLITRK2Q9H156 845 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 SMURF2Q9HAU4 748 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 C20orf141Q9NUB4 165 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 F5H0A9 414 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 H7C1C5 153 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 CLDN34H7C241 214 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 SURF4O15260 269 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 MSR1P21757 451 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 RBM34P42696 430 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 LCN6P62502 163 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 GNB2P62879 340 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 CDK5R2Q13319 367 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 FAM27BQ5VT28 67 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 C16orf87Q6PH81 154 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 LRRN1Q6UXK5 716 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 DLEU7Q6UYE1 221 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 BRD3OSQ6XYD6 125 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 Q6ZS46 218 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 MICU2Q8IYU8 434 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 KIR3DL3Q8N743 410 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 ATG16L2Q8NAA4 619 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 OR10AD1Q8NGE0 317 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 OR10A6Q8NH74 314 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 LRRC8CQ8TDW0 803 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 RASSF5Q8WWW0 418 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 UBE2FQ969M7 185 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 CMBLQ96DG6 245 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 C7orf26Q96N11 449 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 RBP7Q96R05 134 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 CCDC28BQ9BUN5 200 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 PCDHAC1Q9H158 963 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 TXNIPQ9H3M7 391 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 MARCH7Q9H992 704 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 EMC7Q9NPA0 242 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 IL20RAQ9UHF4 553 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 SH3GLB1Q9Y371 365 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 MED31Q9Y3C7 131 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 GMEB1Q9Y692 573 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-220ENST00000482195 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 C12orf71A8MTZ7 269 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 M0QZ24 198 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 CD80P33681 288 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 ERFP50548 548 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 RAG2P55895 527 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 CTXN1P60606 82 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 RPL27P61353 136 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 GUCY1A3Q02108 690 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 PAX8Q06710 450 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 Q6ZR03 302 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 KLBQ86Z14 1044 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 OR8B3Q8NGG8 313 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 OR4F5Q8NH21 305 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 PLEKHA8Q96JA3 519 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 OR8B2Q96RD0 313 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 SIGLEC11Q96RL6 698 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 BEX1Q9HBH7 125 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 IL19Q9UHD0 177 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 KLHL21Q9UJP4 597 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 NDUFAF1Q9Y375 327 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.63□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 TRAV27A0A087WT01 109 aa8.63□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.63□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 TMEM178BH3BS89 294 aa8.63□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 SGCEO43556 437 aa8.63□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 ERLIN1O75477 346 aa8.63□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 OR5F1O95221 314 aa8.63□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 IFI30P13284 250 aa8.63□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 KITLGP21583 273 aa8.63□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 OR1E2P47887 323 aa8.63□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 SLC18A1P54219 525 aa8.63□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 SCRN3Q0VDG4 424 aa8.63□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
DDX39B-220ENST00000482195 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms