RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482054.1

CTSL-205, Transcript of cathepsin L, human

TSL 2

Gene CTSL, Length 908 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSL-205	ENST00000482054	PARP8	Q8N3A8	854 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CTSL-205	ENST00000482054	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CTSL-205	ENST00000482054	C10orf82	Q8WW14	230 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CTSL-205	ENST00000482054	SLC7A6	Q92536	515 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CTSL-205	ENST00000482054	HAVCR1	Q96D42	359 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CTSL-205	ENST00000482054	TPD52L3	Q96J77	140 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CTSL-205	ENST00000482054	SLITRK2	Q9H156	845 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CTSL-205	ENST00000482054	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CTSL-205	ENST00000482054	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
CTSL-205	ENST00000482054		A0A0G2JND7	137 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	CLDN34	H7C241	214 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	TUBG1	P23258	451 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	KDELR2	P33947	212 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	PAX2	Q02962	417 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	OTP	Q5XKR4	325 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	OR5AS1	Q8N127	324 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	MAGEB18	Q96M61	343 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF583	Q96ND8	569 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	WAC	Q9BTA9	647 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	GCM1	Q9NP62	436 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	RHCG	Q9UBD6	479 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054		J3KTA2	159 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	MRAS	O14807	208 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF205	O95201	554 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	GPANK1	O95872	356 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	WNT2	P09544	360 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	IFNA8	P32881	189 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	MTNR1A	P48039	350 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	GUCY1A3	Q02108	690 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	PRKCD	Q05655	676 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	MEST	Q5EB52	335 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	UPRT	Q96BW1	309 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054		Q96M85	177 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	PRSS37	A4D1T9	235 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	OR6C6	A6NF89	314 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	CDC42EP2	O14613	210 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	FFAR1	O14842	300 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	PLAT	P00750	562 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	DBH	P09172	617 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	RAC2	P15153	192 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	CTLA4	P16410	223 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	OMG	P23515	440 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	GPR4	P46093	362 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	SLC9A3	P48764	834 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	GNB2	P62879	340 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	SELENOW	P63302	87 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	AQP6	Q13520	282 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	TRAM2	Q15035	370 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	COQ5	Q5HYK3	327 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	SPATC1	Q76KD6	591 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	FAM122B	Q7Z309	247 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	KLB	Q86Z14	1044 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	PTP4A1	Q93096	173 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	COG8	Q96MW5	612 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	TMEM165	Q9HC07	324 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054		A0A087WUU8	490 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CTSL-205	ENST00000482054	IFNL4	K9M1U5	179 aa		10.8	□□□□□ -0.68

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