RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TAS2R20P59543 309 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 RBX1P62877 108 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 REEP5Q00765 189 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SIGLEC14Q08ET2 396 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ZNF763Q0D2J5 394 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 LMAN2Q12907 356 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 CLINT1Q14677 625 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 MELKQ14680 651 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HSPB2Q16082 182 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 DECR1Q16698 335 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 KHDC3LQ587J8 217 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 METRNLQ641Q3 311 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TMEM205Q6UW68 189 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 LYG2Q86SG7 212 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR2T33Q8NG76 320 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR4C6Q8NH72 309 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 METTL21AQ8WXB1 218 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 MAL2Q969L2 176 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ESAMQ96AP7 390 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 MUCL1Q96DR8 90 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ACY3Q96HD9 319 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TIMP4Q99727 224 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 RHBGQ9H310 441 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 CACNG4Q9UBN1 327 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 INSL6Q9Y581 213 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 V9GY05 133 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PTPRDP23468 1912 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 LAMA3Q16787 3333 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 DRGXA6NNA5 263 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HHLA1C9JL84 531 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 INSIG1O15503 277 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR1F1O43749 312 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 B4GALT3O60512 393 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HIST1H2BKO60814 126 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ABHD16AO95870 558 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OPN1SWP03999 348 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HIST1H2BJP06899 126 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SFTPBP07988 381 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SEC11BP0C7V7 166 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 GZMBP10144 247 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 NPPBP16860 134 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 EPORP19235 508 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SRMP19623 302 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HNF1AP20823 631 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HIST1H2BOP23527 126 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 CHATP28329 748 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 AQP1P29972 269 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR1E1P30953 314 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HIST1H2BBP33778 126 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SNCAP37840 140 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR3A1P47881 315 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SLC11A2P49281 568 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 CARD18P57730 90 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HIST1H2BDP58876 126 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HIST1H2BCP62807 126 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HBA1P69905 142 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SLC35A1P78382 337 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ST3GAL3Q11203 375 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 MADCAM1Q13477 382 aa6.45□□□□□ -1.38
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