RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 ZNF620Q6ZNG0 422 aa11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 ADCK1Q86TW2 530 aa11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 PHC2Q8IXK0 858 aa11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 AQP11Q8NBQ7 271 aa11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 CLDND2Q8NHS1 167 aa11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 SLC25A40Q8TBP6 338 aa11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 RDH5Q92781 318 aa11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 SLCO4A1Q96BD0 722 aa11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 ZNF570Q96NI8 536 aa11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 OSBPL10Q9BXB5 764 aa11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 OR2J1Q9GZK6 312 aa11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 OR52D1Q9H346 318 aa11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 C1orf198Q9H425 327 aa11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 POFUT1Q9H488 388 aa11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 RERGLQ9H628 205 aa11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 NRIP3Q9NQ35 241 aa11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 POLE4Q9NR33 117 aa11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 TREM2Q9NZC2 230 aa11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 BAIAP2Q9UQB8 552 aa11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 CDH10Q9Y6N8 788 aa11.1□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 RNF212BA8MTL3 300 aa11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 FAM157AC9JC47 383 aa11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 PPIHO43447 177 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 IFNA2P01563 188 aa11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 GDI2P50395 445 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 ZSCAN26Q16670 478 aa11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 AVPI1Q5T686 147 aa11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 PTCHD4Q6ZW05 846 aa11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 OR9Q2Q8NGE9 314 aa11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 OR5K1Q8NHB7 308 aa11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 SLC7A6Q92536 515 aa11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 TSSK2Q96PF2 358 aa11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 BCL2L14Q9BZR8 327 aa11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 RACGAP1Q9H0H5 632 aa11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 LPAR2Q9HBW0 351 aa11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 IL20Q9NYY1 176 aa11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 ENOPH1Q9UHY7 261 aa11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 U3KQV3 271 aa11.09□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 DOCK11Q5JSL3 2073 aa11.08□□□□□ -0.63
HPS1-211ENST00000478087 PRSS37A4D1T9 235 aa11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 SOCS2O14508 198 aa11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 SPRY3O43610 288 aa11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 TIPRLO75663 272 aa11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 GASTP01350 101 aa11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 IGHV3-13P01766 116 aa11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 MSR1P21757 451 aa11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 ACHEP22303 614 aa11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 CDH15P55291 814 aa11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 PPP1CBP62140 327 aa11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 TMEM154Q6P9G4 183 aa11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 DNM1P34Q6PK57 102 aa11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 LINC01356Q8N9X3 169 aa11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 ABHD4Q8TB40 342 aa11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 C1orf159Q96HA4 380 aa11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 WACQ9BTA9 647 aa11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 TEX12Q9BXU0 123 aa11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 SYT4Q9H2B2 425 aa11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 VNN3Q9NY84 501 aa11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 DCTN6O00399 190 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 SLC16A7O60669 478 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 PPP1R3DO95685 299 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 IGHV1-46P01743 117 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 SRD5A1P18405 259 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 NOS3P29474 1203 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 MMP15P51511 669 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 SELENOVP59797 346 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 LMO4P61968 165 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 MVKQ03426 396 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 ZNF718Q3SXZ3 478 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 USP51Q70EK9 711 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 JAZF1Q86VZ6 243 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 HPS1Q92902 700 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 C4orf45Q96LM5 186 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 FEVQ99581 238 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 IFT27Q9BW83 186 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 NUAK2Q9H093 628 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 MSL2Q9HCI7 577 aa11.07□□□□□ -0.64
HPS1-211ENST00000478087 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms