RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 KLK13Q9UKR3 277 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 HYOU1Q9Y4L1 999 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNE3Q9Y6H6 103 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 POGZQ7Z3K3 1410 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 SBNO1A3KN83 1393 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 HCFC1P51610 2035 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A087WWV3 80 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 K7EN84 100 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 SCN2BO60939 215 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAPPC6AO75865 159 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 GCGP01275 180 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 OR8U9P0C7N5 309 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ICAM2P13598 275 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 GABRG2P18507 467 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 USF1P22415 310 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2B6P58173 313 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 TAS2R60P59551 318 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 RPS21P63220 83 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 TAL2Q16559 108 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 Q1RN00 199 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD22Q5VYY1 191 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 NPSR1Q6W5P4 371 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 OAFQ86UD1 273 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP4Z1Q86W10 505 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF440Q8IYI8 595 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 CYB561A3Q8NBI2 242 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 OR7G1Q8NGA0 311 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 OR6K2Q8NGY2 324 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 OR8U1Q8NH10 309 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM3DQ96BQ1 224 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 GABARAPL3Q9BY60 117 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 RMND1Q9NWS8 449 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 EURLQ9NYK6 297 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 WWOXQ9NZC7 414 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 PCNX3Q9H6A9 2034 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0A6YYD5 115 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 TVP23AA6NH52 213 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 SEC14L6B5MCN3 397 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD65E5RJM6 399 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC01565O15544 149 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 SNAI2O43623 268 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 NIPSNAP2O75323 286 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ALOX12BO75342 701 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 TIMP1P01033 207 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 F2RP25116 425 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 DIO3P55073 304 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ZSCAN26Q16670 478 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 EOGTQ5NDL2 527 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF691Q5VV52 312 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 RNLSQ5VYX0 342 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAM5Q6NVV9 412 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 FAHD1Q6P587 224 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF497Q6ZNH5 498 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM71AQ8IYT1 594 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 PNKDQ8N490 385 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2G3Q8NGZ4 309 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 OR51A7Q8NH64 312 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 UCN3Q969E3 161 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM122AQ96E09 287 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 B3GALT6Q96L58 329 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 UQCC2Q9BRT2 126 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 CCL28Q9NRJ3 127 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC22A14Q9Y267 594 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 SRRM5B3KS81 715 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD63C9JTQ0 380 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 DFFAO00273 331 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC31A2O15432 143 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 CHTF8P0CG12 524 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF224P0DH78 156 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 OR5H8P0DN80 308 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 CAPN2P17655 700 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 SYT1P21579 422 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 RANBP1P43487 201 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 DNASE1L1P49184 302 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 TAS2R39P59534 338 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2KP61086 200 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 VSNL1P62760 191 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 NSDHLQ15738 373 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC10Q5BKY1 277 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 CPTPQ5TA50 214 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 MARC1Q5VT66 337 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF329Q86UD4 541 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 CBR4Q8N4T8 237 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 CDRT4Q8N9R6 151 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 C7orf33Q8WU49 177 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 IL22RA2Q969J5 263 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 RCN3Q96D15 328 aa4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms