RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 NOS3P29474 1203 aa20.17■□□□□ 0.82
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HOXB3-202ENST00000460160 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXB3-202ENST00000460160 ARL9Q6T311 187 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXB3-202ENST00000460160 LINC00471Q8N535 108 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXB3-202ENST00000460160 RACGAP1Q9H0H5 632 aa20.17■□□□□ 0.82
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HOXB3-202ENST00000460160 ZNF81P51508 661 aa20.17■□□□□ 0.82
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HOXB3-202ENST00000460160 PGM2L1Q6PCE3 622 aa20.17■□□□□ 0.82
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HOXB3-202ENST00000460160 OR2T5Q6IEZ7 315 aa20.16■□□□□ 0.82
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HOXB3-202ENST00000460160 BHLHE40O14503 412 aa20.15■□□□□ 0.82
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HOXB3-202ENST00000460160 IGHV1-46P01743 117 aa20.15■□□□□ 0.82
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HOXB3-202ENST00000460160 CRYBB2P43320 205 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXB3-202ENST00000460160 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
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HOXB3-202ENST00000460160 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa20.14■□□□□ 0.81
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HOXB3-202ENST00000460160 BEX2Q9BXY8 128 aa20.14■□□□□ 0.81
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HOXB3-202ENST00000460160 USP51Q70EK9 711 aa20.13■□□□□ 0.81
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HOXB3-202ENST00000460160 LRGUKQ96M69 825 aa20.13■□□□□ 0.81
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HOXB3-202ENST00000460160 SHARPINQ9H0F6 387 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXB3-202ENST00000460160 TUBG2Q9NRH3 451 aa20.13■□□□□ 0.81
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HOXB3-202ENST00000460160 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
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