RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 BTNL3Q6UXE8 466 aa22.12■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 LRRN1Q6UXK5 716 aa22.12■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 NRMQ8IXM6 262 aa22.12■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 MICU2Q8IYU8 434 aa22.12■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 GCM1Q9NP62 436 aa22.12■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 H7C1C5 153 aa22.11■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 AHCYL1O43865 530 aa22.11■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa22.11■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 KDELR2P33947 212 aa22.11■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 LCN6P62502 163 aa22.11■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 PAX2Q02962 417 aa22.11■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 PRKCDQ05655 676 aa22.11■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 SLC27A4Q6P1M0 643 aa22.11■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 C10orf82Q8WW14 230 aa22.11■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 UPRTQ96BW1 309 aa22.11■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 TPD52L3Q96J77 140 aa22.11■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 A0A0G2JND7 137 aa22.1■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 EFCAB9A8MZ26 197 aa22.1■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 J3QW42 95 aa22.1■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 PLATP00750 562 aa22.1■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 RAC2P15153 192 aa22.1■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 SELENOWP63302 87 aa22.1■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 DEFA6Q01524 100 aa22.1■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 AQP6Q13520 282 aa22.1■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 OFCC1Q8IZS5 231 aa22.1■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 FAM156AQ8NDB6 213 aa22.1■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 MRGBPQ9NV56 204 aa22.1■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 GRHPRQ9UBQ7 328 aa22.1■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 FAM220BPB1ANY3 271 aa22.09■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 RPS2P15880 293 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 ERFP50548 548 aa22.09■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 GNB2P62879 340 aa22.09■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 TRAM2Q15035 370 aa22.09■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 ATG16L2Q8NAA4 619 aa22.09■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa22.09■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 OR13C2Q8NGS9 318 aa22.09■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 MIOXQ9UGB7 285 aa22.09■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 CMYA5Q8N3K9 4069 aa22.09■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa22.08■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa22.08■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 BBIP1A8MTZ0 92 aa22.08■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 XKRYO14609 159 aa22.08■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 EDF1O60869 148 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 CD14P08571 375 aa22.08■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 RPL4P36578 427 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 C1orf94Q6P1W5 598 aa22.08■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 C16orf87Q6PH81 154 aa22.08■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 KLBQ86Z14 1044 aa22.08■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 RAB40AQ8WXH6 277 aa22.08■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 LZICQ8WZA0 190 aa22.08■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 PLEKHA8Q96JA3 519 aa22.08■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 MEGF10Q96KG7 1140 aa22.08■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 FNDC11Q9BVV2 318 aa22.08■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM165Q9HC07 324 aa22.08■■□□□ 1.13
PBRM1-218ENST00000458294 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 TRAV40A0A0B4J280 105 aa22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 OR6C6A6NF89 314 aa22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 MRASO14807 208 aa22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 FSTL3O95633 263 aa22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 GPANK1O95872 356 aa22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 MDKP21741 143 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 FUT4P22083 530 aa22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 RGS6P49758 472 aa22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 MESTQ5EB52 335 aa22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 FBXW12Q6X9E4 464 aa22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 OR5AS1Q8N127 324 aa22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 OR2T12Q8NG77 320 aa22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 OR8G5Q8NG78 346 aa22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 SLC7A6Q92536 515 aa22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 TMIGD2Q96BF3 282 aa22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 Q96M85 177 aa22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 RHCGQ9UBD6 479 aa22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 ATPIF1Q9UII2 106 aa22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 MMP24Q9Y5R2 645 aa22.07■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 PRSS37A4D1T9 235 aa22.06■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 IFNW1P05000 195 aa22.06■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 YAP1P46937 504 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 SRP9P49458 86 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 LSM6P62312 80 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF181Q2M3W8 571 aa22.06■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 FAM122BQ7Z309 247 aa22.06■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 POU5F2Q8N7G0 328 aa22.06■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 OR10AD1Q8NGE0 317 aa22.06■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 OR5L1Q8NGL2 311 aa22.06■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 OR13G1Q8NGZ3 307 aa22.06■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 OR1F12Q8NHA8 337 aa22.06■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 RASD2Q96D21 266 aa22.06■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF570Q96NI8 536 aa22.06■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 NDEL1Q9GZM8 345 aa22.06■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 ASH2LQ9UBL3 628 aa22.06■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 CTLA4P16410 223 aa22.05■■□□□ 1.12
PBRM1-218ENST00000458294 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.6 ms