RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 E9PQ18 207 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 G3V2T6 193 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RER1O15258 196 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SURF4O15260 269 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CIB2O75838 187 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NGFP01138 241 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IFNGP01579 166 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADH4P08319 380 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPI1P17947 270 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ERFP50548 548 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CRISP1P54107 249 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP2R2BQ00005 443 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CLEC12BQ2HXU8 276 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZFP1Q6P2D0 407 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LRP11Q86VZ4 500 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SVOPLQ8N434 492 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYB561A3Q8NBI2 242 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TEX47Q8TBZ9 253 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C4orf45Q96LM5 186 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q96MF0 132 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SORCS2Q96PQ0 1159 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HDHD2Q9H0R4 259 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ELOVL3Q9HB03 270 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RIIAD1A6NNX1 92 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VWC2LB2RUY7 222 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 H3BN98 237 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NDUFS8O00217 210 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPANK1O95872 356 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CSF3P09919 207 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF3P17036 446 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TNK1Q13470 666 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MOGQ16653 247 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MEP1BQ16820 701 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM255AQ5JRV8 349 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ELFN2Q5R3F8 820 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VHLLQ6RSH7 139 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARL9Q6T311 187 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BIVMQ86UB2 503 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ATG16L2Q8NAA4 619 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR10S1Q8NGN2 331 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SYNPRQ8TBG9 265 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C10orf105Q8TEF2 133 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LRTOMTQ8WZ04 291 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MAP6Q96JE9 813 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COG8Q96MW5 612 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FOXN4Q96NZ1 517 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HCAR1Q9BXC0 346 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAB1BQ9H0U4 201 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FN3KQ9H479 309 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLEK2Q9NYT0 353 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A1B0GWJ7 208 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRODHO43272 600 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DOK2O60496 412 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GLCEO94923 617 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM157BP0CG42 384 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC2A5P22732 501 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GIFP27352 417 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FMO3P31513 532 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PYCR1P32322 319 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LIPAP38571 399 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RGS6P49758 472 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MMP15P51511 669 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SELENOVP59797 346 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ERVS71-1P61550 626 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP1CBP62140 327 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF718Q3SXZ3 478 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CFAP77Q6ZQR2 320 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AMIGO2Q86SJ2 522 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TIGD4Q8IY51 512 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IQCF1Q8N6M8 205 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PROKR2Q8NFJ6 384 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR1J1Q8NGS3 322 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ST7LQ8TDW4 575 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HAVCR1Q96D42 359 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 REG4Q9BYZ8 158 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RERGLQ9H628 205 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ENOPH1Q9UHY7 261 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms