RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445346.1

LINC02549-201, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 2549, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC02549, Length 674 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC02549-201ENST00000445346 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 A8MXK9 166 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 CENPBD1B2RD01 187 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 H3BSA7 217 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 SURF4O15260 269 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 SLC2A10O95528 541 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 ABHD16AO95870 558 aa6.65□□□□□ -1.34
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LINC02549-201ENST00000445346 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.65□□□□□ -1.34
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LINC02549-201ENST00000445346 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.65□□□□□ -1.34
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LINC02549-201ENST00000445346 TTMPQ5BVD1 217 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 GPR157Q5UAW9 335 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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LINC02549-201ENST00000445346 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa6.65□□□□□ -1.34
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LINC02549-201ENST00000445346 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 TMEM38AQ9H6F2 299 aa6.65□□□□□ -1.34
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LINC02549-201ENST00000445346 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 KLHL21Q9UJP4 597 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC02549-201ENST00000445346 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.65□□□□□ -1.34
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LINC02549-201ENST00000445346 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 GMNCA6NCL1 334 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 SRRM5B3KS81 715 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 C22orf46C9J442 243 aa6.64□□□□□ -1.35
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LINC02549-201ENST00000445346 FUT1P19526 365 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 PCBD1P61457 104 aa6.64□□□□□ -1.35
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LINC02549-201ENST00000445346 DUSP7Q16829 419 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 RUNDC3AQ59EK9 446 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 C10orf128Q5T292 105 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 LCE1DQ5T752 114 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 SLC27A4Q6P1M0 643 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 C10orf111Q8N326 155 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 OR6T1Q8NGN1 323 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 SLC26A7Q8TE54 656 aa6.64□□□□□ -1.35
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LINC02549-201ENST00000445346 ASB10Q8WXI3 467 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 UPRTQ96BW1 309 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 ZBTB9Q96C00 473 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 CMBLQ96DG6 245 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 MPP4Q96JB8 637 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 C20orf173Q96LM9 149 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 MAGEB18Q96M61 343 aa6.64□□□□□ -1.35
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LINC02549-201ENST00000445346 OR52B2Q96RD2 323 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 CITED1Q99966 193 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 OR2H1Q9GZK4 316 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 MARCH7Q9H992 704 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 NOX4Q9NPH5 578 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 C1RLQ9NZP8 487 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 VAPAQ9P0L0 249 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 MIOXQ9UGB7 285 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 IL19Q9UHD0 177 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 X6R8D5 127 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 TMEM178BH3BS89 294 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC02549-201ENST00000445346 IFNL4K9M1U5 179 aa6.63□□□□□ -1.35
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