RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 SDK1Q7Z5N4 2213 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 LDLRAD4O15165 306 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF208O43345 1280 aa13.42□□□□□ -0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 CD37P11049 281 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 FSTP19883 344 aa13.42□□□□□ -0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 PNLIPRP2P54317 469 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 CXADRP78310 365 aa13.42□□□□□ -0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 CCINQ13939 588 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 ZNF679Q8IYX0 411 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 OR4S1Q8NGB4 309 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 RNF141Q8WVD5 230 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 ASB5Q8WWX0 329 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 ASB17Q8WXJ9 295 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 SEC11CQ9BY50 192 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 PNPP00491 289 aa13.42□□□□□ -0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 SKP1P63208 163 aa13.42□□□□□ -0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 KLHL26Q53HC5 615 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 AVPI1Q5T686 147 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 PHF19Q5T6S3 580 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 CD163Q86VB7 1156 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 GATSQ8NAP1 163 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 AVL9Q8NBF6 648 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 OR4K17Q8NGC6 315 aa13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM235A6NFC5 223 aa13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 I3L1I5 382 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 HEXAP06865 529 aa13.41□□□□□ -0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 SLC35D2Q76EJ3 337 aa13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 BAP18Q8IXM2 172 aa13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 PPP1R14AQ96A00 147 aa13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 FAHD2AQ96GK7 314 aa13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 CMKLR1Q99788 373 aa13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 SEMA6CQ9H3T2 930 aa13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 FANCFQ9NPI8 374 aa13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 MMP26Q9NRE1 261 aa13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 TGFBR3LH3BV60 316 aa13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 CRYBA1P05813 215 aa13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 CRHP06850 196 aa13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 THEGLP0DJG4 465 aa13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 RABIFP47224 123 aa13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 CCR4P51679 360 aa13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa13.41□□□□□ -0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 RHOUQ7L0Q8 258 aa13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 OR4A4PQ8NGN8 299 aa13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 GPBAR1Q8TDU6 330 aa13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 SFT2D1Q8WV19 159 aa13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 MRGPRFQ96AM1 343 aa13.41□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa13.4□□□□□ -0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 F12P00748 615 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 PSMB6P28072 239 aa13.4□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 OR7A5Q15622 319 aa13.4□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 NUDT9Q9BW91 350 aa13.4□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 TREM1Q9NP99 234 aa13.4□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 CACNA1CQ13936 2221 aa13.4□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 LOC100509620A0A075B734 347 aa13.4□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 FITM1A5D6W6 292 aa13.4□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 OIP5O43482 229 aa13.4□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 HLA-DQA2P01906 255 aa13.4□□□□□ -0.26
TOP3B-206ENST00000436282 ABOP16442 354 aa13.4□□□□□ -0.26
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