RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409403.6

CLK1-202, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CLK1, Length 1,664 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-202ENST00000409403 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 ARHGAP1Q07960 439 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 IRF4Q15306 451 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 SLC5A12Q1EHB4 618 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 CTSL3PQ5NE16 218 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 MARCH8Q5T0T0 291 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 LIPJQ5W064 366 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 FRG2Q64ET8 278 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 REEP3Q6NUK4 255 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 TMEM71Q6P5X7 295 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 VITQ6UXI7 678 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 IL20RBQ6UXL0 311 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 APOOLQ6UXV4 268 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 NHLRC1Q6VVB1 395 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 CLEC20AQ6ZU45 233 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 C6orf120Q7Z4R8 191 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 PXKQ7Z7A4 578 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 IQCHQ86VS3 1027 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 ACBD7Q8N6N7 88 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 HORMAD2Q8N7B1 307 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 AVL9Q8NBF6 648 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 OR6N1Q8NGY5 312 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 OR2G2Q8NGZ5 317 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 SLC22A18Q96BI1 424 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 APOLD1Q96LR9 279 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 FRG2BQ96QU4 278 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 ZNF607Q96SK3 696 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 TEAD3Q99594 435 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 TRIM2Q9C040 744 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 CHST5Q9GZS9 411 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 SYT4Q9H2B2 425 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 OR51V1Q9H2C8 321 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 TMEM27Q9HBJ8 222 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 FBXW2Q9UKT8 454 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 HSF4Q9ULV5 492 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 TNFSF18Q9UNG2 199 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 OR10H1Q9Y4A9 318 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 WIF1Q9Y5W5 379 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 A0A0G2JK05 382 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 MGAT4DA6NG13 374 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 TMEM210A6NLX4 147 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 YJEFN3A6XGL0 299 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 HIDE1A8MVS5 230 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 M0QZ92 97 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 M0QZK8 103 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 TAPBPO15533 448 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 PLPP2O43688 288 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 GGCTO75223 188 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 SLC25A12O75746 678 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 FARS2O95363 451 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 IGLV3-25P01717 112 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 HCKP08631 526 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 ETFAP13804 333 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 ADRB3P13945 408 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 TNFRSF1BP20333 461 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 ACHEP22303 614 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 HTR2CP28335 458 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 GABRR2P28476 465 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 ZNF84P51523 738 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 CASP6P55212 293 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 H2BFSP57053 126 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 RAP1AP62834 184 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 SLC7A9P82251 487 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 GLO1Q04760 184 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 CACNG1Q06432 222 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 ZNF234Q14588 700 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 RSU1Q15404 277 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 ZBTB6Q15916 424 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 LINC00303Q3SY05 128 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 C11orf87Q6NUJ2 197 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 CEACAM19Q7Z692 300 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 CLECL1Q8IZS7 167 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 Q8N1X5 172 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 ZFP41Q8N8Y5 198 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 SLC30A7Q8NEW0 376 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 OR5D16Q8NGK9 328 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 OR5M1Q8NGP8 315 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 OR1J2Q8NGS2 313 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 ARRDC2Q8TBH0 407 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 PIGKQ92643 395 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 FGF11Q92914 225 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 MAL2Q969L2 176 aa4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CLK1-202ENST00000409403 MED8Q96G25 268 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms