RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 AQP11Q8NBQ7 271 aa17.26■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 SDR9C7Q8NEX9 313 aa17.26■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 OR52E2Q8NGJ4 325 aa17.26■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 OR2T29Q8NH02 315 aa17.26■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 OR1F12Q8NHA8 337 aa17.26■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 SOX7Q9BT81 388 aa17.26■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 FN3KQ9H479 309 aa17.26■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa17.26■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa17.26■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 U3KQV3 271 aa17.26■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 PLSCR5A0PG75 271 aa17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 OR6C68A6NDL8 312 aa17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 OR6C6A6NF89 314 aa17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 H3BSA7 217 aa17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 ACOT8O14734 319 aa17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 LMX1BO60663 402 aa17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 CDC14BO60729 498 aa17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 UBOX5O94941 541 aa17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF81P51508 661 aa17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 TSTQ16762 297 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM166AQ6J272 317 aa17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 PGM2L1Q6PCE3 622 aa17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 RACGAP1Q9H0H5 632 aa17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 TBCCD1Q9NVR7 557 aa17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 LHFPL6Q9Y693 200 aa17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP17.24■□□□□ 0.351e-6■■■■□ 25.3
ANKRD39-201ENST00000393537 SPRY3O43610 288 aa17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 RP2O75695 350 aa17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 TGFAP01135 160 aa17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 RAP2AP10114 183 aa17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 MMP15P51511 669 aa17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 CCNIQ14094 377 aa17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBTB46Q86UZ6 589 aa17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 NPEPL1Q8NDH3 523 aa17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 GJC3Q8NFK1 279 aa17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC26A10Q8NG04 563 aa17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 OR8D4Q8NGM9 314 aa17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 HPS1Q92902 700 aa17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 POFUT1Q9H488 388 aa17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 NARFLQ9H6Q4 476 aa17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 DECR2Q9NUI1 292 aa17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 TBC1D23Q9NUY8 699 aa17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM160Q9NX00 188 aa17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 IL20Q9NYY1 176 aa17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNS2Q9ULS6 477 aa17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 BHLHE40O14503 412 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 GYG2O15488 501 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 PPIHO43447 177 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 IGHV1-46P01743 117 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 TFP02787 698 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 DBHP09172 617 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 GSTM3P21266 225 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM33P57088 247 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 TEKQ02763 1124 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 MICAQ29983 383 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 CORO6Q6QEF8 472 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 ADGRG5Q8IZF4 528 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 CHID1Q9BWS9 393 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 SAP30LQ9HAJ7 183 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 CYSLTR2Q9NS75 346 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 STARD10Q9Y365 291 aa17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 HLA-DQA2P01906 255 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 IGFBP5P24593 272 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 LIPAP38571 399 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 CRYBB2P43320 205 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 HIST1H3AP68431 136 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 COX10Q12887 443 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 PSG7Q13046 419 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC36A3Q495N2 470 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 DNAL1Q4LDG9 190 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 USP51Q70EK9 711 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 HIST2H3AQ71DI3 136 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 LINC00346Q8IVM7 164 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 CYB561A3Q8NBI2 242 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 TSSK6Q9BXA6 273 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 BEX2Q9BXY8 128 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 SHARPINQ9H0F6 387 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 HDHD2Q9H0R4 259 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 MSL2Q9HCI7 577 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 ATPIF1Q9UII2 106 aa17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 AQP12BA6NM10 295 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 SOX14O95416 240 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 TUBG1P23258 451 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 PYCR1P32322 319 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM209AQ5JX71 171 aa17.21■□□□□ 0.35
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC18B1Q6NT16 456 aa17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms