RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373387.8

GARNL3-202, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GARNL3, Length 3,800 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-202ENST00000373387 EFSO43281 561 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 SIGLEC6O43699 453 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 SSX5O60225 188 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 SLC25A12O75746 678 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 CTHP32929 405 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 HHEXQ03014 270 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 PPP1R1AQ13522 171 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 ELOCQ15369 112 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 SHEQ5VZ18 495 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 BEST3Q8N1M1 668 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 SLC26A10Q8NG04 563 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 TCTN2Q96GX1 697 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 DHDHQ9UQ10 334 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 SDK1Q7Z5N4 2213 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 C17orf105B2RV13 164 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 SCDO00767 359 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 LINC01565O15544 149 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 ATG12O94817 140 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 AMY2AP04746 511 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 FAM157CP0CG43 387 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 MEF2DQ14814 521 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 MST1LQ2TV78 715 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 TMEM31Q5JXX7 168 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 OR6S1Q8NH40 331 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 PIGMQ9H3S5 423 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 GAREM1Q9H706 876 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 FAM206AQ9NX38 181 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 OR2AT4A6NND4 320 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 H3BSH0 61 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 CLDN4O14493 209 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 FADS1O60427 444 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 FCER2P06734 321 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 GABRG2P18507 467 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 CD34P28906 385 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 AKT2P31751 481 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 CAPZBP47756 277 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 FASLGP48023 281 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 SLC6A9P48067 706 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 GSK3AP49840 483 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 SKP1P63208 163 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 NAAAQ02083 359 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 ZP4Q12836 540 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 TDGQ13569 410 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 EBPQ15125 230 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 STK11Q15831 433 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 RNF138Q8WVD3 245 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 PIK3IP1Q96FE7 263 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 RNF126Q9BV68 326 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 PLCL2Q9UPR0 1127 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 TMEM218A2RU14 115 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 MEGF11A6BM72 1044 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 ZNF28P17035 718 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 CD1CP29017 333 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 PBX2P40425 430 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 IL15RAQ13261 267 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 DEGS2Q6QHC5 323 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 FRMD1Q8N878 549 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 KCNK17Q96T54 332 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 ZNF175Q9Y473 711 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 TMEM235A6NFC5 223 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 EPOPA6NHQ4 379 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 MS4A18H0YCH9 400 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 RAD1O60671 282 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 MPZL1O95297 269 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 ACTL6AO96019 429 aa6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GARNL3-202ENST00000373387 APOC3P02656 99 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms