RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 SELENOWP63302 87 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 PRKCDQ05655 676 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 SCRN3Q0VDG4 424 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 KLF10Q13118 480 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 BAMBIQ13145 260 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 TRAM2Q15035 370 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM155Q4W5P6 130 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 OTPQ5XKR4 325 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 Q6ZR03 302 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 DOK3Q7L591 496 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 OR5AS1Q8N127 324 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF283Q8N7M2 679 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 OR2T12Q8NG77 320 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 CMBLQ96DG6 245 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 SAMD8Q96LT4 415 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 MRI1Q9BV20 369 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF747Q9BV97 191 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 FNDC11Q9BVV2 318 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 PLEK2Q9NYT0 353 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 GRHPRQ9UBQ7 328 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 STARD10Q9Y365 291 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 INSIG2Q9Y5U4 225 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa8.71□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 LOC100653049A0A140TA62 436 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 ELOVL7A1L3X0 281 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 BBIP1A8MTZ0 92 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 XKRYO14609 159 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 TMPRSS2O15393 492 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 SGCEO43556 437 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 KRT34O76011 436 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 COX5BP10606 129 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 PRTN3P24158 256 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 GPR4P46093 362 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 SLC9A3P48764 834 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 ERFP50548 548 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 FHL1Q13642 323 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 ZMYND11Q15326 602 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 MAPRE2Q15555 327 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 ESCO2Q56NI9 601 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 MESTQ5EB52 335 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 COQ5Q5HYK3 327 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF730Q6ZMV8 503 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 OFCC1Q8IZS5 231 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 LZICQ8WZA0 190 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 SLC7A6Q92536 515 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 Q96M85 177 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF570Q96NI8 536 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 OR2V2Q96R30 315 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 SIGLEC11Q96RL6 698 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 GPA33Q99795 319 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 RERGLQ9H628 205 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 GID8Q9NWU2 228 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 PTTG3PQ9NZH4 202 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 OR5V1Q9UGF6 321 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 IL19Q9UHD0 177 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 SNX13Q9Y5W8 968 aa8.7□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 A0A087WUU8 490 aa8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 A8MXK9 166 aa8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 F5H0A9 414 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 J3QW42 95 aa8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 CDC42EP2O14613 210 aa8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 SURF4O15260 269 aa8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF205O95201 554 aa8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF682O95780 498 aa8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 NPPAP01160 153 aa8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 IFNW1P05000 195 aa8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 KITLGP21583 273 aa8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 GUCY1A3Q02108 690 aa8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 AQP6Q13520 282 aa8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 ANKDD1AQ495B1 522 aa8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 PRR31Q5SQ13 230 aa8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 TBPL2Q6SJ96 375 aa8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 JAZF1Q86VZ6 243 aa8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 ATG16L2Q8NAA4 619 aa8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 HAVCR1Q96D42 359 aa8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 WACQ9BTA9 647 aa8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 SAR1AQ9NR31 198 aa8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa8.68□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa8.68□□□□□ -1.02
CLRN3-201ENST00000368671 PRSS37A4D1T9 235 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms