RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 FAM166AQ6J272 317 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 FAM122BQ7Z309 247 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF101Q8IZC7 436 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 OR2T33Q8NG76 320 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 OR1J1Q8NGS3 322 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SNX33Q8WV41 574 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 IFT27Q9BW83 186 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF416Q9BWM5 594 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 OR2H1Q9GZK4 316 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 WNT5BQ9H1J7 359 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 OR52D1Q9H346 318 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 CHODLQ9H9P2 273 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 EMC7Q9NPA0 242 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 POLE4Q9NR33 117 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D23Q9NUY8 699 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 IL20Q9NYY1 176 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 GPR160Q9UJ42 338 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 U3KQV3 271 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 LRP5LA4QPB2 252 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 RIIAD1A6NNX1 92 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 C17orf100A8MU93 164 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 G3V2T6 193 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 H3BN98 237 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SOCS2O14508 198 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 RENP00797 406 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 MT-ND5P03915 603 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 HMGN1P05114 100 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SCG5P05408 212 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 TACSTD2P09758 323 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ACHEP22303 614 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 IL2RGP31785 369 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 WNT5AP41221 380 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 CENPAP49450 140 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 BLVRAP53004 296 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 FXYD6P3P58550 94 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 CCNIQ14094 377 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 TRIP10Q15642 601 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF774Q6NX45 483 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SYT9Q86SS6 491 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PARP8Q8N3A8 854 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 OR5K1Q8NHB7 308 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ABHD4Q8TB40 342 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 FEVQ99581 238 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 GPA33Q99795 319 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SYT4Q9H2B2 425 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 RERGLQ9H628 205 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM160Q9NX00 188 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL21Q9UJP4 597 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 KCNS2Q9ULS6 477 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PLSCR5A0PG75 271 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 H3BSA7 217 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 DOK2O60496 412 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 LMX1BO60663 402 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SLC16A7O60669 478 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 TIPRLO75663 272 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R3DO95685 299 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ABHD16AO95870 558 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 GASTP01350 101 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 IFNA2P01563 188 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3-13P01766 116 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 FAM157CP0CG43 387 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 OSMP13725 252 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF3P17036 446 aa6.54□□□□□ -1.36
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