RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 DSCR9P59020 149 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 HIST1H3AP68431 136 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 TEKQ02763 1124 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CARTPTQ16568 116 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CFAP77Q6ZQR2 320 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 HIST2H3AQ71DI3 136 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 PROKR2Q8NFJ6 384 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 TEX47Q8TBZ9 253 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 OR2J1Q9GZK6 312 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 KLHL21Q9UJP4 597 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 BAIAP2Q9UQB8 552 aa12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 TLN2Q9Y4G6 2542 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 VWC2LB2RUY7 222 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 LYNX1G3V0Z9 82 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ABHD16AO95870 558 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 HLA-DQA2P01906 255 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 CSF3P09919 207 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 LYNX1P0DP58 116 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 POU1F1P28069 291 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 GGT2P36268 569 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 PPP1CBP62140 327 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 NKPD1Q17RQ9 610 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 SLC18B1Q6NT16 456 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ACSM5Q6NUN0 579 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC121Q6ZUS5 278 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 OR1F12Q8NHA8 337 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 HCAR1Q9BXC0 346 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 MED20Q9H944 212 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 CMC2Q9NRP2 79 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 NF1P21359 2839 aa12.77□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV3-13P01766 116 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 HPXP02790 462 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 OSMP13725 252 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ANXA8P13928 327 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 DAOP14920 347 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 SLC25A16P16260 332 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 SPI1P17947 270 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 GRK5P34947 590 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 MAGEB1P43366 347 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ATP6AP1Q15904 470 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF718Q3SXZ3 478 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ELFN2Q5R3F8 820 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM154Q6P9G4 183 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ATG16L2Q8NAA4 619 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 GJC3Q8NFK1 279 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 OR2T4Q8NH00 348 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 COQ7Q99807 217 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 PIMREGQ9BSJ6 248 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 MS4A5Q9H3V2 200 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ELOVL3Q9HB03 270 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ATPIF1Q9UII2 106 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 FAM183AA6NL82 134 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 RIIAD1A6NNX1 92 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 CIB2O75838 187 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 IFNGP01579 166 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF3P17036 446 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 GCH1P30793 250 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 DAPP51397 102 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGDIAP52565 204 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 SLC25A1P53007 311 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 SELENOVP59797 346 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 GINS1Q14691 196 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 LINC01590Q5TEZ4 76 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 AMIGO2Q86SJ2 522 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF511Q8NB15 262 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 OR10S1Q8NGN2 331 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 OR5K1Q8NHB7 308 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 UBASH3BQ8TF42 649 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 LRTOMTQ8WZ04 291 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 MAP6Q96JE9 813 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 BPESC1Q9GZL8 116 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 HDHD2Q9H0R4 259 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 WDR76Q9H967 626 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF556Q9HAH1 456 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 TBCCD1Q9NVR7 557 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 STARD10Q9Y365 291 aa12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms