RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 CMTM4Q8IZR5 234 aa15.82■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 MDS2Q8NDY4 140 aa15.82■□□□□ 0.12
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ACTB-201ENST00000331789 B4GALT7Q9UBV7 327 aa15.82■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 OR5V1Q9UGF6 321 aa15.82■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa15.82■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa15.82■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 ZNF716A6NP11 495 aa15.82■□□□□ 0.12
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ACTB-201ENST00000331789 SLC6A15Q9H2J7 730 aa15.81■□□□□ 0.12
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF878C9JN71 531 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 TTRP02766 147 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 MSR1P21757 451 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 ACHEP22303 614 aa15.8■□□□□ 0.12
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ACTB-201ENST00000331789 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 PYHIN1Q6K0P9 492 aa15.8■□□□□ 0.12
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ACTB-201ENST00000331789 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 NME2P1O60361 137 aa15.8■□□□□ 0.12
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ACTB-201ENST00000331789 LIPCP11150 499 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 NME2P22392 152 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 HSD11B1P28845 292 aa15.8■□□□□ 0.12
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ACTB-201ENST00000331789 CD300CQ08708 224 aa15.8■□□□□ 0.12
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ACTB-201ENST00000331789 TMEM244Q5VVB8 128 aa15.8■□□□□ 0.12
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ACTB-201ENST00000331789 ELMOD2Q8IZ81 293 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 LRRC18Q8N456 261 aa15.8■□□□□ 0.12
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ACTB-201ENST00000331789 LINC01387J3KSC0 135 aa15.79■□□□□ 0.12
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ACTB-201ENST00000331789 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 AAED1Q7RTV5 226 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 SERPINA12Q8IW75 414 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 ZFP3Q96NJ6 502 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 NELFAQ9H3P2 528 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 CAMK2AQ9UQM7 478 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 TMEM127O75204 238 aa15.78■□□□□ 0.12
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