RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 CADM3Q8N126 398 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 C19orf18Q8NEA5 215 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 FAM206AQ9NX38 181 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 HHLA2Q9UM44 414 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 ANXA2P2A6NMY6 339 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF878C9JN71 531 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 BCL2L15Q5TBC7 163 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 PYHIN1Q6K0P9 492 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 ASB5Q8WWX0 329 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 WACQ9BTA9 647 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 SLC22A4Q9H015 551 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 DLL3Q9NYJ7 618 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 ARGFXA6NJG6 315 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 MAS1P04201 325 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 SELENOPP49908 381 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 CLDN15P56746 228 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 MDS2Q8NDY4 140 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 TTTY12Q9BZ98 90 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 ASH2LQ9UBL3 628 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 RCE1Q9Y256 329 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 PTPRBP23467 1997 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF716A6NP11 495 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 CD2P06729 351 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 CALCBP10092 127 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 LIPCP11150 499 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 NR4A2P43354 598 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 RRADP55042 308 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 LSM6P62312 80 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 PDSS1Q5T2R2 415 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM244Q5VVB8 128 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 IGF2-ASQ6U949 168 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 LIN7BQ9HAP6 207 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 CLEC4AQ9UMR7 237 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1B0GVC2 190 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 OR5H15A6NDH6 313 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 A6NIN4 97 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 PLA2G10O15496 165 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 NME2P1O60361 137 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 NME2P22392 152 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 RFC3P40938 356 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 C20orf196Q8IYI0 205 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 DTX3Q8N9I9 347 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 DNAAF1Q8NEP3 725 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 AGAP4Q96P64 663 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 NIPAL2Q9H841 368 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 DHHO43323 396 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 SP1P08047 785 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 MSR1P21757 451 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 SOX8P57073 446 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 SLC25A25Q6KCM7 469 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 NEURL2Q9BR09 285 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 NELFAQ9H3P2 528 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 FOXJ3Q9UPW0 622 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 FREM2Q5SZK8 3169 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 TTLL8A6PVC2 850 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 UBL3O95164 117 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 FSTP19883 344 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 CFPP27918 469 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 VASH2Q86V25 355 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 ROBO4Q8WZ75 1007 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 ULBP2Q9BZM5 246 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 CELA3AP09093 270 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 CLDN12P56749 244 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 SGCAQ16586 387 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 ASPHD2Q6ICH7 369 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 ELMOD2Q8IZ81 293 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 OR13C3Q8NGS6 347 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 NEDD4LQ96PU5 975 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 ABHD1Q96SE0 405 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF416Q9BWM5 594 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 MOB1AQ9H8S9 216 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 OR5V1Q9UGF6 321 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 ETV7Q9Y603 341 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD8-201ENST00000313173 FAM166BA8MTA8 275 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXD8-201ENST00000313173 GFRA3O60609 400 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXD8-201ENST00000313173 HSD11B1P28845 292 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXD8-201ENST00000313173 PLGLB1Q02325 96 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXD8-201ENST00000313173 FCRLAQ7L513 359 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXD8-201ENST00000313173 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXD8-201ENST00000313173 CMTM4Q8IZR5 234 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXD8-201ENST00000313173 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXD8-201ENST00000313173 NABP1Q96AH0 204 aa23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms