RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 J3QRE1 110 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 THBDP07204 575 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 RPS27P42677 84 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 FOXB2Q5VYV0 432 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 C22orf34Q6ZV56 151 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 SSX8Q7RTT4 187 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF367Q7RTV3 350 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 SLC16A14Q7RTX9 510 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 DPY19L4Q7Z388 723 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 CDC20BQ86Y33 519 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 FBXO17Q96EF6 278 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 WACQ9BTA9 647 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 POLR1DQ9Y2S0 133 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 C12orf71A8MTZ7 269 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 INMTO95050 263 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 WNT11O96014 354 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 SPARCP09486 303 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 AQP6Q13520 282 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 SLC18B1Q6NT16 456 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 DPPA2Q7Z7J5 298 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 SYT9Q86SS6 491 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00346Q8IVM7 164 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 SLC35F2Q8IXU6 374 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC36Q8IYA8 594 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 OTOSQ8NHW6 89 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 FGFBP3Q8TAT2 258 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 MND1Q9BWT6 205 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 CDADC1Q9BWV3 514 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 KCNN2Q9H2S1 579 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 NGBQ9NPG2 151 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 OBP2BQ9NPH6 170 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 ASH2LQ9UBL3 628 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 CEPT1Q9Y6K0 416 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 H3BSA7 217 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 MYL12BO14950 172 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 TMCC2O75069 709 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 OR2T7P0C7T2 308 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 CRYGSP22914 178 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 PSMB9P28065 219 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 CAPZA2P47755 286 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 HCCSP53701 268 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 GP2P55259 537 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 SLC36A2Q495M3 483 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF454Q8N9F8 522 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 WDR31Q8NA23 367 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 OR2T27Q8NH04 317 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 MNTQ99583 582 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 JAM3Q9BX67 310 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 SLC25A15Q9Y619 301 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 NOL3O60936 208 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 UBL3O95164 117 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 IGHA1P01876 353 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF32P17041 273 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 PCBD1P61457 104 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 HIST1H3AP68431 136 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 CORO6Q6QEF8 472 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 HIST2H3AQ71DI3 136 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 INPP5EQ9NRR6 644 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 B3GNT2Q9NY97 397 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 COPS3Q9UNS2 423 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD11-201ENST00000249504 A6NNC1 897 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 PTHP01270 115 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 HLA-HP01893 362 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 LCKP06239 509 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 ADRA2AP08913 450 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 PATE4P0C8F1 98 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 ALOX5APP20292 161 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 ACTC1P68032 377 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 ACTA1P68133 377 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 TUBA1BP68363 451 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 TIGD6Q17RP2 521 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 TUBA1AQ71U36 451 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 NANOGP1Q8N7R0 232 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 GJC3Q8NFK1 279 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 OR10H4Q8NGA5 316 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 ST7LQ8TDW4 575 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 MAP6Q96JE9 813 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 NOX3Q9HBY0 568 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa16.96■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM129A0AVI4 362 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 GOSR1O95249 250 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXD11-201ENST00000249504 SCRN3Q0VDG4 424 aa16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms