RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 OR1F12Q8NHA8 337 aa19.14■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 OSBPL10Q9BXB5 764 aa19.14■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 KRT84Q9NSB2 600 aa19.14■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 VSTM5A8MXK1 200 aa19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 CLPTM1O96005 669 aa19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 HLA-DQA2P01906 255 aa19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 DBHP09172 617 aa19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 HTR5AP47898 357 aa19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 EFNB1P98172 346 aa19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 RAB35Q15286 201 aa19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 ICA1LQ8NDH6 482 aa19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 OR10S1Q8NGN2 331 aa19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 MAP6Q96JE9 813 aa19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 C4orf45Q96LM5 186 aa19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 CIB1Q99828 191 aa19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 SYT3Q9BQG1 590 aa19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 BCL2L14Q9BZR8 327 aa19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 DLL4Q9NR61 685 aa19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa19.12■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 ZAR1LA6NP61 321 aa19.12■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 RPS23P62266 143 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 ELFN2Q5R3F8 820 aa19.12■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 PLBD1Q6P4A8 553 aa19.12■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa19.12■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 CPOQ8IVL8 374 aa19.12■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 OR10H5Q8NGA6 315 aa19.12■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 OR1J1Q8NGS3 322 aa19.12■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 Q96MF0 132 aa19.12■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 SORCS2Q96PQ0 1159 aa19.12■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 MARCH7Q9H992 704 aa19.12■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 TVP23BQ9NYZ1 205 aa19.12■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 ATPIF1Q9UII2 106 aa19.12■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 KCNG2Q9UJ96 466 aa19.12■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 POLR1DQ9Y2S0 133 aa19.12■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 LCKP06239 509 aa19.11■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 SLC2A5P22732 501 aa19.11■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 FMO3P31513 532 aa19.11■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 PPOXP50336 477 aa19.11■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 TEX30Q5JUR7 227 aa19.11■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 SLX4IPQ5VYV7 408 aa19.11■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 C10orf67Q8IYJ2 551 aa19.11■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 BBS1Q8NFJ9 593 aa19.11■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 COQ7Q99807 217 aa19.11■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 POFUT1Q9H488 388 aa19.11■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 LY6HO94772 140 aa19.1■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 GLCEO94923 617 aa19.1■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 BMP4P12644 408 aa19.1■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 ZNF823P16415 610 aa19.1■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 IGFBP5P24593 272 aa19.1■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN26Q16670 478 aa19.1■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 C12orf73Q69YU5 71 aa19.1■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A40Q8TBP6 338 aa19.1■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 CDADC1Q9BWV3 514 aa19.1■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 HDHD2Q9H0R4 259 aa19.1■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 OR51V1Q9H2C8 321 aa19.1■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 TBCCD1Q9NVR7 557 aa19.1■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 DUSP13Q9UII6 198 aa19.1■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD65E5RJM6 399 aa19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 PRKYO43930 277 aa19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 F12P00748 615 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 ALPLP05186 524 aa19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 ADRA2AP08913 450 aa19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 MPV17P39210 176 aa19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 ENTPD1P49961 510 aa19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 EFNA4P52798 201 aa19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 SNAPC1Q16533 368 aa19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 SPATA46Q5T0L3 261 aa19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 TIGD4Q8IY51 512 aa19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 OR6K6Q8NGW6 343 aa19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 ABHD4Q8TB40 342 aa19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 SYNPRQ8TBG9 265 aa19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 GABARAPL3Q9BY60 117 aa19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 OR2J1Q9GZK6 312 aa19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 USE1Q9NZ43 259 aa19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 STARD10Q9Y365 291 aa19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa19.09■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 TRIM64A6NGJ6 449 aa19.08■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 TRIM64BA6NI03 449 aa19.08■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 E9PQ18 207 aa19.08■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 SSX4O60224 188 aa19.08■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 ALDH3B1P43353 468 aa19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms