RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	SELENOW	P63302	87 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	12.44	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	KLF10	Q13118	480 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	ESCO2	Q56NI9	601 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF583	Q96ND8	569 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF570	Q96NI8	536 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	GPA33	Q99795	319 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	POLE4	Q9NR33	117 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	RHCG	Q9UBD6	479 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	FXYD1	O00168	92 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	TSPAN19	P0C672	248 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	COX5B	P10606	129 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	IFI44L	Q53G44	452 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	SAMD8	Q96LT4	415 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	EMC7	Q9NPA0	242 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	AUP1	Q9Y679	476 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	PPIAL4D	F5H284	164 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	GPR4	P46093	362 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	CENPA	P49450	140 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	BTG1	P62324	171 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	GUCY1A3	Q02108	690 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	PRKCD	Q05655	676 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	FOXL1	Q12952	345 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	PSG7	Q13046	419 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	AQP6	Q13520	282 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	CMBL	Q96DG6	245 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	NUP50	Q9UKX7	468 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	AHCYL1	O43865	530 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	ICMT	O60725	284 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	IGHV2-70	P01814	119 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	CD14	P08571	375 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	RGS6	P49758	472 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	CDK5R2	Q13319	367 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	ZBED5	Q49AG3	693 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	AWAT1	Q58HT5	328 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM162A	Q96A26	154 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	SAR1A	Q9NR31	198 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	IL19	Q9UHD0	177 aa		12.41	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	PRSS37	A4D1T9	235 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	LRRC30	A6NM36	301 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599		J3KTA2	159 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	IFNL4	K9M1U5	179 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	CXCR6	O00574	342 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	GMNN	O75496	209 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF154	Q13106	437 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	BAMBI	Q13145	260 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	OR5AS1	Q8N127	324 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	PTP4A1	Q93096	173 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	RCN3	Q96D15	328 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599		Q96M85	177 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	OR2V2	Q96R30	315 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		12.4	□□□□□ -0.42
TARDBP-231	ENST00000639599	OPN4	Q9UHM6	478 aa		12.4	□□□□□ -0.42

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