RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	PMPCA	Q10713	525 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	SPHAR	Q15513	63 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	CDON	Q4KMG0	1287 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	NABP1	Q96AH0	204 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	FOXB1	Q99853	325 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	LRBA	P50851	2863 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392		A0A1W2PPL8	197 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF254	O75437	659 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	APOL3	O95236	402 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	CST2	P09228	141 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	TACSTD2	P09758	323 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	GLI4	P10075	376 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	CHRNB4	P30926	498 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	DCTD	P32321	178 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	OPRM1	P35372	400 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	HIST1H3A	P68431	136 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	GPR50	Q13585	617 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392		Q6ZT83	130 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	LINGO2	Q7L985	606 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	RPRML	Q8N4K4	120 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	STARD4	Q96DR4	205 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ALG8	Q9BVK2	526 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	METTL15	A6NJ78	407 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	MPZL1	O95297	269 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	PTH	P01270	115 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	MT-ND5	P03915	603 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	SCG5	P05408	212 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	CD1A	P06126	327 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	PAX7	P23759	505 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	EDNRA	P25101	427 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	MAP2K4	P45985	399 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	TAS2R43	P59537	309 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	PCBD1	P61457	104 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	TGFBR3	Q03167	851 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	AQP6	Q13520	282 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	P2RY6	Q15077	328 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	CDSN	Q15517	529 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	SGCA	Q16586	387 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	CCDC58	Q4VC31	144 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	GPR107	Q5VW38	600 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	BEND4	Q6ZU67	534 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	GJC3	Q8NFK1	279 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ST7L	Q8TDW4	575 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	SNX33	Q8WV41	574 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	MGLL	Q99685	303 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ABHD6	Q9BV23	337 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	PIGM	Q9H3S5	423 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	C1orf198	Q9H425	327 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	PROCR	Q9UNN8	238 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	COPS3	Q9UNS2	423 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	C19orf84	I3L1E1	186 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	GPANK1	O95872	356 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	LCK	P06239	509 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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