RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599811.5

CD22-223, Transcript of CD22 molecule, human

TSL 4

Gene CD22, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CD22-223	ENST00000599811	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CD22-223	ENST00000599811	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CD22-223	ENST00000599811	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CD22-223	ENST00000599811	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CD22-223	ENST00000599811		A0A087WUJ7	227 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811		A0A1B0GVI7	797 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	MEIOC	A2RUB1	952 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	HMGN4	O00479	90 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	ZFPL1	O95159	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	ABHD16A	O95870	558 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	QDPR	P09417	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	CCDC159	P0C7I6	412 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	ADORA3	P0DMS8	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	FAH	P16930	419 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	CLRN1	P58418	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	HOXC5	Q00444	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	MELK	Q14680	651 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	IL23R	Q5VWK5	629 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	FDX2	Q6P4F2	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	CREG2	Q8IUH2	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	OR5AS1	Q8N127	324 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	MAP6	Q96JE9	813 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	OR5M11	Q96RB7	305 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	EPYC	Q99645	322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	RAB17	Q9H0T7	212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	FBP2	O00757	339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	NPFF	O15130	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	ADAM20	O43506	726 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	RNF13	O43567	381 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	ANGPTL7	O43827	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	OR10H3	O60404	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	IGHG1	P01857	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	ZNF32	P17041	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	GSK3A	P49840	483 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	ERVK-25	P63136	954 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	KCNJ8	Q15842	424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811		Q6ZR03	302 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	LCA5	Q86VQ0	697 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	OR6X1	Q8NH79	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	AGR3	Q8TD06	166 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	TMEM54	Q969K7	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	CMBL	Q96DG6	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	SSX3	Q99909	188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	TMEM247	A6NEH6	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	PLPP3	O14495	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	GLRA3	O75311	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	JTB	O76095	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CD22-223	ENST00000599811	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.8 ms