RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS6KA3	P51812	740 aa		18.56	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	MNAT1	P51948	309 aa		18.56	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1CB	P62140	327 aa		18.56	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	CCL8	P80075	99 aa		18.56	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		18.56	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	RFX4	Q33E94	735 aa		18.56	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		18.56	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		18.56	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	ABHD4	Q8TB40	342 aa		18.56	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	C4orf45	Q96LM5	186 aa		18.56	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		18.56	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200		H3BSA7	217 aa		18.55	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	WNT9B	O14905	357 aa		18.55	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	MPZL1	O95297	269 aa		18.55	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNA2	P01563	188 aa		18.55	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	RRM2	P31350	389 aa		18.55	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	GSS	P48637	474 aa		18.55	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	CDH15	P55291	814 aa		18.55	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	GLO1	Q04760	184 aa		18.55	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNMB1	Q16558	191 aa		18.55	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	OTP	Q5XKR4	325 aa		18.55	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		18.55	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	FANK1	Q8TC84	345 aa		18.55	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	OR52D1	Q9H346	318 aa		18.55	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		18.55	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		18.55	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	DCTN6	O00399	190 aa		18.54	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	ARPC3	O15145	178 aa		18.54	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10H3	O60404	316 aa		18.54	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R3D	O95685	299 aa		18.54	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP6V1B2	P21281	511 aa		18.54	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	GCH1	P30793	250 aa		18.54	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	CRYBB2	P43320	205 aa		18.54	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	HMGA2	P52926	109 aa		18.54	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	MXRA7	P84157	204 aa		18.54	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	AQP6	Q13520	282 aa		18.54	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		18.54	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		18.54	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		18.54	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		18.54	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200		B2RBV5	119 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	SGCE	O43556	437 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	DOK2	O60496	412 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF81	P51508	661 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	CCNI	Q14094	377 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	NSL1	Q96IY1	281 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	TSSK2	Q96PF2	358 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	RERGL	Q9H628	205 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		18.53	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	OR6C6	A6NF89	314 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC14B	O60729	498 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM107A	O95990	144 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV1-46	P01743	117 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	MT-ND5	P03915	603 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	ADH4	P08319	380 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	GAA	P10253	952 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC6A6	P31641	620 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGEA2	P43356	314 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	HTR5A	P47898	357 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM209A	Q5JX71	171 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		18.52	■□□□□ 0.56
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT36	O76013	467 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	ABHD16A	O95870	558 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	GPANK1	O95872	356 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	T-ENOL	P0DO92	83 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	CRABP1	P29762	137 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	THBS2	P35442	1172 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNGR2	P38484	337 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGDIA	P52565	204 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST1H3A	P68431	136 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPAN31	Q12999	210 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	PSG7	Q13046	419 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	CR1L	Q2VPA4	569 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	ARL9	Q6T311	187 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	OR6V1	Q8N148	313 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC7A6	Q92536	515 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	SAMD8	Q96LT4	415 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	NMNAT3	Q96T66	252 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	POFUT1	Q9H488	388 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms