RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560521.5

RABGGTA-217, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-217ENST00000560521 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 TLDC2A0PJX2 215 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 CENPBD1B2RD01 187 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 C5orf58C9J3I9 102 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 K7EIL1 84 aa7.38□□□□□ -1.23
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RABGGTA-217ENST00000560521 THY1P04216 161 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 F13BP05160 661 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ACADSP16219 412 aa7.38□□□□□ -1.23
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RABGGTA-217ENST00000560521 LAP3P28838 519 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 TGFBR2P37173 567 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 PSMB10P40306 273 aa7.38□□□□□ -1.23
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RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF181Q2M3W8 571 aa7.38□□□□□ -1.23
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RABGGTA-217ENST00000560521 C10orf111Q8N326 155 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.38□□□□□ -1.23
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RABGGTA-217ENST00000560521 HAVCR1Q96D42 359 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 MAGEB18Q96M61 343 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 TOR3AQ9H497 397 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 KIF17Q9P2E2 1029 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF229Q9UJW7 825 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 STARD10Q9Y365 291 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 RAP2CQ9Y3L5 183 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 USH1CQ9Y6N9 552 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 WDR91A4D1P6 747 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 CLIC1O00299 241 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SDHDO14521 159 aa7.37□□□□□ -1.23
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RABGGTA-217ENST00000560521 FMO6PO60774 539 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ABHD16AO95870 558 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 IL6P05231 212 aa7.37□□□□□ -1.23
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RABGGTA-217ENST00000560521 CST2P09228 141 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 TUBG1P23258 451 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ARF6P62330 175 aa7.37□□□□□ -1.23
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RABGGTA-217ENST00000560521 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 FADDQ13158 208 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ARMC4Q5T2S8 1044 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF613Q6PF04 617 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ARL9Q6T311 187 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 LYG1Q8N1E2 194 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 GALNT4Q8N4A0 578 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 NPEPL1Q8NDH3 523 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 MNS1Q8NEH6 495 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 OR10AD1Q8NGE0 317 aa7.37□□□□□ -1.23
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RABGGTA-217ENST00000560521 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ZBTB18Q99592 522 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 MCHR1Q99705 422 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 TUBG2Q9NRH3 451 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 PNPOQ9NVS9 261 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 CTSZQ9UBR2 303 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 A0A1W2PRG6 482 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 MCIDASD6RGH6 385 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 F5H5P2 479 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 TYROBPO43914 113 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 FCN3O75636 299 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC22A3O75751 556 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 HIST1H2ABP04908 130 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SERPINE1P05121 402 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SCG5P05408 212 aa7.36□□□□□ -1.23
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