RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556459.1

PAPOLA-220, Transcript of poly(A) polymerase alpha, humanhuman

TSL 5

Gene PAPOLA, Length 959 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLA-220ENST00000556459 DCST2Q5T1A1 773 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 ARMC4Q5T2S8 1044 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 H3F3CQ6NXT2 135 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 GUSBP11Q6P575 273 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 ULK3Q6PHR2 472 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 UGT2A3Q6UWM9 527 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 TMEM107Q6UX40 140 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 IZUMO2Q6UXV1 221 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 FRRS1Q6ZNA5 592 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 RTL4Q6ZR62 310 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 NDUFAF7Q7L592 441 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 SZRD1Q7Z422 152 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 MCEMP1Q8IX19 187 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 C10orf111Q8N326 155 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 Q8N377 158 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 CBR4Q8N4T8 237 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 EID2Q8N6I1 236 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 RNF148Q8N7C7 305 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 NUP37Q8NFH4 326 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 B3GNT7Q8NFL0 401 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 GPR32P1Q8NGA4 272 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 OR10G8Q8NGN5 311 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 OR8J1Q8NGP2 316 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 OR9A4Q8NGU2 314 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 OR2Y1Q8NGV0 311 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 OR52P1PQ8NH57 321 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 RHOXF1Q8NHV9 184 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 ZNF721Q8TF20 911 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 GIPC3Q8TF64 312 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 TMBIM1Q969X1 311 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 TMCO6Q96DC7 493 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 VMP1Q96GC9 406 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 IMMP1LQ96LU5 166 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 COL21A1Q96P44 957 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 SLC29A1Q99808 456 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 ZNF559Q9BR84 538 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 TMEM43Q9BTV4 400 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 PRRG3Q9BZD7 231 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 VN1R1Q9GZP7 353 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 FN3KQ9H479 309 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 DUSP21Q9H596 190 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 TMEM27Q9HBJ8 222 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 SDHAF3Q9NRP4 125 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 HAO2Q9NYQ3 351 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 COPS7AQ9UBW8 275 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 CIDEBQ9UHD4 219 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 TMCC3Q9ULS5 477 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 TMEM5Q9Y2B1 443 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 POFUT2Q9Y2G5 429 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 NTNG1Q9Y2I2 539 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 SNX8Q9Y5X2 465 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa3.29□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 GBF1Q92538 1859 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 A0A087WUJ7 227 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 A0A087WXM4 84 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 A0A087WZY1 265 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 A0A0B4J2E0 115 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 A0A1B0GX12 115 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 SH3PXD2BA1X283 911 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 TRAPPC13A5PLN9 417 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 TRIM64BA6NI03 449 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 MSGN1A6NI15 193 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 CLDN24A6NM45 220 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 CENPBD1B2RD01 187 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 C17orf105B2RV13 164 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 C9J4A7 227 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 C9JVG2 144 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 FFAR1O14842 300 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 ARPC3O15145 178 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 ZNF208O43345 1280 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 HCRTR1O43613 425 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 CHP2O43745 196 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 OR2T1O43869 369 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 TSPAN2O60636 221 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 FCMRO60667 390 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 SDC3O75056 442 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 RDH16O75452 317 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 E2F6O75461 281 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 TSPAN9O75954 239 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 OR6B1O95007 311 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 CCNB2O95067 398 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 RCBTB2O95199 551 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 SNX4O95219 450 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 GADD45GO95257 159 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 IGHV3-13P01766 116 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 CLPSP04118 112 aa3.28□□□□□ -1.88
PAPOLA-220ENST00000556459 LYNP07948 512 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms