RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	TAB1	Q15750	504 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	GABRA6	Q16445	453 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF74	Q16587	644 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC22A25	Q6T423	547 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SPATA24	Q86W54	205 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	NRM	Q8IXM6	262 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC18	Q8N456	261 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	NSMAF	Q92636	917 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	DPF1	Q92782	380 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	C14orf79	Q96F83	325 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PRRC1	Q96M27	445 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	FKRP	Q9H9S5	495 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CRLF2	Q9HC73	371 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	INIP	Q9NRY2	104 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CD300A	Q9UGN4	299 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SPG11	Q96JI7	2443 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	USF3	Q68DE3	2245 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A087WUU8	490 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	DPRX	A6NFQ7	191 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	OR5H1	A6NKK0	313 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TNFRSF11B	O00300	401 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	XKRY	O14609	159 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ABCD4	O14678	606 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	FFAR1	O14842	300 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP5H	O75947	161 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ITGA5	P08648	1049 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	QDPR	P09417	244 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	THRB	P10828	461 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ACADS	P16219	412 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	IGFBP2	P18065	325 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP6V1B2	P21281	511 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CCNO	P22674	350 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CRYGS	P22914	178 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC9A3	P48764	834 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	FABP6	P51161	128 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF84	P51523	738 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ART1	P52961	327 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	IST1	P53990	364 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	VLDLR	P98155	873 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	BSPH1	Q075Z2	132 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CD47	Q08722	323 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	NPRL3	Q12980	569 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ZBED5	Q49AG3	693 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	BEX5	Q5H9J7	111 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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