RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 ASAH1Q13510 395 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 IGFBP7Q16270 282 aa7.75□□□□□ -1.17
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PTPRB-208ENST00000550358 DNAJA3Q96EY1 480 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 SMIM14Q96QK8 99 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 CLEC1BQ9P126 229 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 SLC23A1Q9UHI7 598 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PQD3 144 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 ABCD4O14678 606 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 SSX5O60225 188 aa7.74□□□□□ -1.17
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PTPRB-208ENST00000550358 PPP2CAP67775 309 aa7.74□□□□□ -1.17
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PTPRB-208ENST00000550358 C10orf35Q96D05 121 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 CTRCQ99895 268 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 C7orf72A4D263 438 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 TGM1P22735 817 aa7.73□□□□□ -1.17
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