RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531857.1

PKP3-208, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 4

Gene PKP3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-208ENST00000531857 GAL3ST1Q99999 423 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 C1orf198Q9H425 327 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 PTHP01270 115 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 NCK1P16333 377 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 GATA3P23771 443 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 FPR2P25090 351 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 PCGF2P35227 344 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 RBMXP38159 391 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 MMP15P51511 669 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 ARHGDIAP52565 204 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 FOXL1Q12952 345 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 HIST3H3Q16695 136 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 DUSP7Q16829 419 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 TUSC1Q2TAM9 212 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 SPRNQ5BIV9 151 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 ENTPD8Q5MY95 495 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 SPATA46Q5T0L3 261 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 DPPA2Q7Z7J5 298 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 ZNF101Q8IZC7 436 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 OR6T1Q8NGN1 323 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 MCHR2Q969V1 340 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 ELMOD3Q96FG2 381 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 ARHGDIGQ99819 225 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 NTN4Q9HB63 628 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 NANSQ9NR45 359 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 BAG5Q9UL15 447 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 ISPDA4D126 451 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 FMO6PO60774 539 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 MT-ND5P03915 603 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 OPN1SWP03999 348 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 CCNOP22674 350 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 KDELR2P33947 212 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 MPV17P39210 176 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 WNT5AP41221 380 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 CLRN1P58418 232 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 PLP2Q04941 152 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 MOGQ16653 247 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 RFX4Q33E94 735 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 SYT14Q8NB59 555 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 GPR32P1Q8NGA4 272 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 OR4D11Q8NGI4 311 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 LZICQ8WZA0 190 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 NRBF2Q96F24 287 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 UBAP1Q9NZ09 502 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 H0YAE9 185 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 IGHG1P01857 330 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 ASAH2BP0C7U1 165 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 STOMP27105 288 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 APLNRP35414 380 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 MAGEA2P43356 314 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 RPS6KA3P51812 740 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 NRN1LQ496H8 165 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 FAM209AQ5JX71 171 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 THEM4Q5T1C6 240 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 CBLL1Q75N03 491 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 CCDC80Q76M96 950 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 AMIGO2Q86SJ2 522 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 DEFB108BQ8NET1 73 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 SEPHS2Q99611 448 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 EVA1AQ9H8M9 152 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 MMP26Q9NRE1 261 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 DCAF16Q9NXF7 216 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 ZNF69Q9UC07 566 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 SLC7A7Q9UM01 511 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP3-208ENST00000531857 LOC100509620A0A075B734 347 aa14.64□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa14.64□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 GNGT2O14610 69 aa14.64□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 TNFAIP8O95379 198 aa14.64□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 HIST1H2ABP04908 130 aa14.64□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 F13BP05160 661 aa14.64□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 PRTN3P24158 256 aa14.64□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 CDAP32320 146 aa14.64□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 ZNF84P51523 738 aa14.64□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 DEFA6Q01524 100 aa14.64□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 HSF2Q03933 536 aa14.64□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.64□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PKP3-208ENST00000531857 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms