RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 PHC2Q8IXK0 858 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 CCDC36Q8IYA8 594 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 ZNF511Q8NB15 262 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 OR6K6Q8NGW6 343 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 C11orf40Q8WZ69 217 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 CNBD2Q96M20 576 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 SEC14L2O76054 403 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 OR8G3PP0DMU2 310 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 DBTP11182 482 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 MTNR1AP48039 350 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 RPS7P62081 194 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 CSNK2BP67870 215 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 SORDQ00796 357 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 POU4F2Q12837 409 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 MED21Q13503 144 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 TBRG1Q3YBR2 411 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 KLHL24Q6TFL4 600 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 DPPA2Q7Z7J5 298 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 SYT9Q86SS6 491 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 P2RY8Q86VZ1 359 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 STEAP2Q8NFT2 490 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 FOXN4Q96NZ1 517 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 SEC61A2Q9H9S3 476 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 ADGRL4Q9HBW9 690 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 OBP2BQ9NPH6 170 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 SLC17A5Q9NRA2 495 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 ZNF224Q9NZL3 707 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 CRIM1Q9NZV1 1036 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 CIB4A0PJX0 185 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 TVP23AA6NH52 213 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 OR5H1A6NKK0 313 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 C16orf97H3BN30 126 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 J3QRE1 110 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 RAD51DO75771 328 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 MPZL1O95297 269 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 FARS2O95363 451 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 RAF1P04049 648 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 SBK2P0C263 348 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 CCDC159P0C7I6 412 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 PIPP12273 146 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 UGT2B10P36537 528 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 ENTPD1P49961 510 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 NUDT6P53370 316 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 HIST1H3AP68431 136 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 FAM27E3Q08E93 113 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 SGCAQ16586 387 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 KRT80Q6KB66 452 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 UGT2A3Q6UWM9 527 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 B3GLCTQ6Y288 498 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 HIST2H3AQ71DI3 136 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 SLC16A9Q7RTY1 509 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 SKA3Q8IX90 412 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 LRRC46Q96FV0 321 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 INTS14Q96SY0 518 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 WDR76Q9H967 626 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 EMC7Q9NPA0 242 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 FKBP14Q9NWM8 211 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 B3GNT2Q9NY97 397 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 LRCH1Q9Y2L9 728 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 LHFPL6Q9Y693 200 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 A6NNC1 897 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 SLC1A7O00341 560 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 PSKH1P11801 424 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 IL32P24001 234 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 RAB40BQ12829 278 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 AQP6Q13520 282 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 TSC22D1Q15714 1073 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 MEP1BQ16820 701 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 HIKESHIQ53FT3 197 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 TIMM23BQ5SRD1 257 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 SSX8Q7RTT4 187 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 WDR31Q8NA23 367 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 OR10H5Q8NGA6 315 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 HTRA1Q92743 480 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 LGALS12Q96DT0 336 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 RNFT2Q96EX2 444 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 MNTQ99583 582 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 JAM3Q9BX67 310 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 AMDHD2Q9Y303 409 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 C12orf71A8MTZ7 269 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 SELENOFO60613 162 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 HLA-DQA2P01906 255 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 PPP3CBP16298 524 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 ZNF823P16415 610 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-208ENST00000529677 PAX7P23759 505 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms