RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 KCNS3Q9BQ31 491 aa3.59□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 MARVELD1Q9BSK0 173 aa3.59□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 KATNB1Q9BVA0 655 aa3.59□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 BBS2Q9BXC9 721 aa3.59□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 NLNQ9BYT8 704 aa3.59□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 PRRG3Q9BZD7 231 aa3.59□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 ANKRD19PQ9H560 264 aa3.59□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 BCL2L10Q9HD36 194 aa3.59□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 ABCB9Q9NP78 766 aa3.59□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 EQTNQ9NQ60 294 aa3.59□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 PTTG3PQ9NZH4 202 aa3.59□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 CLEC2DQ9UHP7 191 aa3.59□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 TMCC3Q9ULS5 477 aa3.59□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 ITM2BQ9Y287 266 aa3.59□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 SNX8Q9Y5X2 465 aa3.59□□□□□ -1.83
SGCE-211ENST00000522045 DOCK3Q8IZD9 2030 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 A0A0X1KG70 313 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 FABP12A6NFH5 140 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 C5orf58C9J3I9 102 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ANHXE9PGG2 379 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SLC30A4O14863 429 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CASC3O15234 703 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RGS5O15539 181 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PRKYO43930 277 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SH3BP5O60239 455 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SLC19A2O60779 497 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 B4GALT2O60909 372 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CDRT1O95170 752 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SOX14O95416 240 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SOD1P00441 154 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 IGHV2-70P01814 119 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 BCHEP06276 602 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 MYL12AP19105 171 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GSTM3P21266 225 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 KHKP50053 298 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ETV1P50549 477 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SMSP52788 366 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 BTG1P62324 171 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RPS25P62851 125 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ARF1P84077 181 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 HOXC5Q00444 222 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 MC1RQ01726 317 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 C2orf80Q0P641 193 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GANABQ14697 944 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TATDN3Q17R31 274 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 HSD17B12Q53GQ0 312 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PDZK1Q5T2W1 519 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 HACD4Q5VWC8 232 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 LIPKQ5VXJ0 399 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TRIQKQ629K1 86 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 C22orf42Q6IC83 251 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 MZT2BQ6NZ67 158 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 C1orf94Q6P1W5 598 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CNIH2Q6PI25 160 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PLET1Q6UQ28 207 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 FAM131AQ6UXB0 335 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TMEM64Q6YI46 380 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 FAM89BQ8N5H3 189 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TBC1D19Q8N5T2 526 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TCEANCQ8N8B7 351 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 YIPF7Q8N8F6 280 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SYT14Q8NB59 555 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR4D11Q8NGI4 311 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR2A12Q8NGT7 310 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR9A1PQ8NGU1 263 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR52N1Q8NH53 320 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ENKURQ8TC29 256 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SLC7A13Q8TCU3 470 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SFXN5Q8TD22 340 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CXorf40AQ8TE69 158 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ACOT12Q8WYK0 555 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SMPDL3AQ92484 453 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 UFD1Q92890 307 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CREB3L1Q96BA8 519 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 UPRTQ96BW1 309 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 AP2M1Q96CW1 435 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 DTD2Q96FN9 168 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 MED8Q96G25 268 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 FOPNLQ96NB1 174 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 IL4I1Q96RQ9 567 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ZNF607Q96SK3 696 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 DHRS9Q9BPW9 319 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TTYH2Q9BSA4 534 aa3.58□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TMEM43Q9BTV4 400 aa3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms