RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 ALOX12BO75342 701 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 NMBP08949 121 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 JMJD7P0C870 316 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 S1PR1P21453 382 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 ABCD3P28288 659 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 PSMB10P40306 273 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 OR12D2P58182 307 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 GMFBP60983 142 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 DCAF7P61962 342 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 OTPQ5XKR4 325 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 RPTNQ6XPR3 784 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 QSOX2Q6ZRP7 698 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf210Q8IVY1 113 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 SLITRK4Q8IW52 837 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 SIRT6Q8N6T7 355 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 DUSP18Q8NEJ0 188 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 OR4K17Q8NGC6 315 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM234Q8WY98 164 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 CXorf58Q96LI9 332 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 HCAR1Q9BXC0 346 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 WWTR1Q9GZV5 400 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 BCO1Q9HAY6 547 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 SPEGQ15772 3267 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 SPTA1P02549 2419 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 PLSCR5A0PG75 271 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 C17orf51A8MQB3 221 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 NCR1O76036 304 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 ANXA3P12429 323 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 SERPINF1P36955 418 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 CDKN1BP46527 198 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 SOX2P48431 317 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 RBX1P62877 108 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 E2F1Q01094 437 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 PLK5Q496M5 336 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 PRAMEF20Q5VT98 475 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 BICRALQ6AI39 1079 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 NIPAL3Q6P499 406 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 KMT5CQ86Y97 462 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 CMIPQ8IY22 773 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 OR5L2Q8NGL0 311 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 OR5W2Q8NH69 310 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 CLDN23Q96B33 292 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 C3orf49Q96BT1 292 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 TOLLIPQ9H0E2 274 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 MED28Q9H204 178 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 GPR27Q9NS67 375 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 RNF24Q9Y225 148 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PPC1 479 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 LIMS3P0CW19 117 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 LIMS4P0CW20 117 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 NPR2P20594 1047 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 SSTR2P30874 369 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 RPS27P42677 84 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 SLC6A8P48029 635 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 ACTC1P68032 377 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 ACTA1P68133 377 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 CFHR1Q03591 330 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 INSL4Q14641 139 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 PMS2CLQ68D20 193 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 LAX1Q8IWV1 398 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 MCEMP1Q8IX19 187 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 SVBPQ8N300 66 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF615Q8N8J6 731 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 OR10A7Q8NGE5 316 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 OR5M1Q8NGP8 315 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 OR1N1Q8NGS0 311 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 TM9SF4Q92544 642 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 GUCD1Q96NT3 240 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 OR11A1Q9GZK7 315 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 ASB6Q9NWX5 421 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 A0A087WUJ7 227 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM129A0AVI4 362 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 OTX2P32243 289 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 SFTPDP35247 375 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 RBM34P42696 430 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 CD81P60033 236 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms