RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 TAS2R40P59535 323 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP10-1P60331 282 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACTBP60709 375 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 H3F3AP84243 136 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 GUCY1A3Q02108 690 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 BDH1Q02338 343 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHIT1Q13231 466 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 GALEQ14376 348 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 HES1Q14469 280 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRT72Q14CN4 511 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 MFSD13AQ14CX5 517 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPCS2Q15005 226 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR7A5Q15622 319 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRADDQ15628 312 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 CD226Q15762 336 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDK4Q16654 411 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 DEFB135Q30KP9 77 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPDYE7PQ495Y7 208 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC25A53Q5H9E4 307 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDKL4Q5MAI5 379 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 CEP85LQ5SZL2 805 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 HHATQ5VTY9 493 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 CARD17Q5XLA6 110 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDPF1Q6NVV7 123 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM180BQ6P0A1 224 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDC73Q6P1J9 531 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 CBLN3Q6UW01 205 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 HACD2Q6Y1H2 254 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINGO2Q7L985 606 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 C6orf120Q7Z4R8 191 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC35E3Q7Z769 313 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 CPLX4Q7Z7G2 160 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 DPPA2Q7Z7J5 298 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZBTB46Q86UZ6 589 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 EGFL6Q8IUX8 553 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM185AQ8N0U4 392 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 TCAIMQ8N3R3 496 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q8N402 240 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 DEFB125Q8N687 156 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q8N7P7 452 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 COX18Q8N8Q8 333 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZIC4Q8N9L1 334 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR10AD1Q8NGE0 317 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR6Y1Q8NGX8 325 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR6N1Q8NGY5 312 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR13G1Q8NGZ3 307 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 HUS1BQ8NHY5 278 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDNFQ8TB73 568 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPR119Q8TDV5 335 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 PIK3R3Q92569 461 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 TNFRSF14Q92956 283 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 ERGIC1Q969X5 290 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF488Q96MN9 340 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR5B12Q96R08 314 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 FOXB1Q99853 325 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRSS27Q9BQR3 290 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 NEURL2Q9BR09 285 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATG101Q9BSB4 218 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 NICN1Q9BSH3 213 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNF126Q9BV68 326 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 HCAR1Q9BXC0 346 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 ULBP2Q9BZM5 246 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRIM5Q9C035 493 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 HOXD1Q9GZZ0 328 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLEKHA1Q9HB21 404 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 EQTNQ9NQ60 294 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHRAC1Q9NRG0 131 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 PNPOQ9NVS9 261 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 NLKQ9UBE8 527 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNF7Q9UBF6 113 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00527Q9UJ94 153 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPS6KA6Q9UK32 745 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 NFU1Q9UMS0 254 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 AURKCQ9UQB9 309 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 RASD1Q9Y272 281 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 MYRFQ9Y2G1 1151 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMED3Q9Y3Q3 217 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 HYOU1Q9Y4L1 999 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa1.44□□□□□ -2.18
RNU6-548P-201ENST00000517083 HILPDAQ9Y5L2 63 aa1.44□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms