RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 PRAMEF20Q5VT98 475 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 GABRG1Q8N1C3 465 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 HMGB4Q8WW32 186 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 TCTN2Q96GX1 697 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 PHB2Q99623 299 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 MCHR1Q99705 422 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 PELI2Q9HAT8 420 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 CYTL1Q9NRR1 136 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 CACNG4Q9UBN1 327 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 STEAP1Q9UHE8 339 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 FAM96BQ9Y3D0 163 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 A0A0B4J2A0 478 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 C17orf102A2RUQ5 167 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 PIN1P1O15428 100 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 F13BP05160 661 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 SLC35E2P0CK97 266 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 RD3LP0DJH9 198 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 SULT1A2P50226 295 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 PLAC9Q5JTB6 97 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 SPATA46Q5T0L3 261 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 OR4C6Q8NH72 309 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF417Q8TAU3 575 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 STACQ99469 402 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 PAAF1Q9BRP4 392 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 LGR4Q9BXB1 951 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 MARCH5Q9NX47 278 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 SHPKQ9UHJ6 478 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 C7orf77A4D0Y5 90 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 FAM183AA6NL82 134 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 M0R143 59 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 ZBTB25P24278 435 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 NTSP30990 170 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 UCP2P55851 309 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 DHRS2Q13268 280 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 ADIPOQQ15848 244 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 NKAIN2Q5VXU1 208 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 LEMD1Q68G75 181 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 CDPF1Q6NVV7 123 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 FAAP20Q6NZ36 180 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 NUBPLQ8TB37 319 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 LAT2Q9GZY6 243 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 IL21RQ9HBE5 538 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 SERTAD3Q9UJW9 196 aa8□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 HELZP42694 1942 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 OR52A4PA6NMU1 304 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF716A6NP11 495 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 PPP1R3DO95685 299 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 SLC16A8O95907 504 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 WNT11O96014 354 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 TACSTD2P09758 323 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF735P0CB33 412 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 BCKDHBP21953 392 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 TAS2R31P59538 309 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 SLAQ13239 276 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 Q499Y3 187 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 STAC2Q6ZMT1 411 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 ACOT4Q8N9L9 421 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 OR13C5Q8NGS8 318 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 GPR148Q8TDV2 347 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM56Q96MV1 263 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 AQP10Q96PS8 301 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 RGCCQ9H4X1 137 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 LRFN1Q9P244 771 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 PSG11Q9UQ72 335 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 A0A1B0GW64 132 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 AIFM1O95831 613 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 HTR2CP28335 458 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 CD1BP29016 333 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 BSGP35613 385 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 PSMB10P40306 273 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 SPINT3P49223 89 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 ATP1B3P54709 279 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 TAS2R38P59533 333 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 TGM3Q08188 693 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 HSPB3Q12988 150 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 WDFY1Q8IWB7 410 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 SLC35F2Q8IXU6 374 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF679Q8IYX0 411 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 OR2L13Q8N349 312 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.99□□□□□ -1.13
GPBP1-208ENST00000514387 LINC00597Q9H2U6 94 aa7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms