RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497368.1

UBE3C-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3C, human

TSL 2

Gene UBE3C, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE3C-208	ENST00000497368	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368		Q6ZR03	302 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	FAM122B	Q7Z309	247 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	C10orf82	Q8WW14	230 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	LRRC58	Q96CX6	371 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF607	Q96SK3	696 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	EPYC	Q99645	322 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	BEX2	Q9BXY8	128 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	OPN4	Q9UHM6	478 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE3C-208	ENST00000497368	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368		A0A0G2JND7	137 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TMEM247	A6NEH6	219 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	EVPLL	A8MZ36	301 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368		H7C1C5	153 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	NME4	O00746	187 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SERPINB7	O75635	380 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	OR5F1	O95221	314 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	RAB36	O95755	333 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	NGF	P01138	241 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	IGHV1-46	P01743	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	IGHV2-5	P01817	119 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ACADS	P16219	412 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ACHE	P22303	614 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	AHCY	P23526	432 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	PAX7	P23759	505 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	LCN6	P62502	163 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	PSG4	Q00888	419 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	FOXE3	Q13461	319 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	MEST	Q5EB52	335 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	COQ5	Q5HYK3	327 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	AVPI1	Q5T686	147 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SNX32	Q86XE0	403 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SYT14	Q8NB59	555 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TMEM239	Q8WW34	195 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	RCN3	Q96D15	328 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	PRRC1	Q96M27	445 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	GPA33	Q99795	319 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	NANS	Q9NR45	359 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TREM2	Q9NZC2	230 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ARMCX1	Q9P291	453 aa		4.65	□□□□□ -1.67

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