RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 HEXAP06865 529 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 ANXA8P13928 327 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 CCNOP22674 350 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 GCH1P30793 250 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 OR10G2Q8NGC3 310 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 OR52E2Q8NGJ4 325 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 OR2T4Q8NH00 348 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 OR4K13Q8NH42 304 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 TEX47Q8TBZ9 253 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 SNX33Q8WV41 574 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 HTRA1Q92743 480 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 NRBF2Q96F24 287 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 SORCS2Q96PQ0 1159 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 TEX12Q9BXU0 123 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 WNT5BQ9H1J7 359 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 TBC1D23Q9NUY8 699 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 TBCCD1Q9NVR7 557 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 PLEK2Q9NYT0 353 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 REV1Q9UBZ9 1251 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 DUSP13Q9UII6 198 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 KLHL21Q9UJP4 597 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 B9D1Q9UPM9 204 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 POLR1DQ9Y2S0 133 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 A0A1W2PPW3 197 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 DOK2O60496 412 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 FKBP6O75344 327 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 TP53P04637 393 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 FAM157BP0CG42 384 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 RGS6P49758 472 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 CBX1P83916 185 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 ECH1Q13011 328 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 PCGF3Q3KNV8 242 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 ZMAT1Q5H9K5 638 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 Q71RC1 249 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 OR6V1Q8N148 313 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 NPEPL1Q8NDH3 523 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 OR1J1Q8NGS3 322 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 AKR7LQ8NHP1 331 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 C4orf45Q96LM5 186 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 FEVQ99581 238 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 PIMREGQ9BSJ6 248 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 CDADC1Q9BWV3 514 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 TSSK6Q9BXA6 273 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 HDHD2Q9H0R4 259 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 EGLN3Q9H6Z9 239 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 EMC7Q9NPA0 242 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 CYSLTR2Q9NS75 346 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 ASH2LQ9UBL3 628 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 LOC100509620A0A075B734 347 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 OR6C6A6NF89 314 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 RNF223E7ERA6 249 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 IGHV3-13P01766 116 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 ADRA2AP08913 450 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 FCGR1AP12314 374 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 CCL2P13500 99 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 ZNF823P16415 610 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 HTR5AP47898 357 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 NKPD1Q17RQ9 610 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 ZNF774Q6NX45 483 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 TMEM154Q6P9G4 183 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 C10orf67Q8IYJ2 551 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 ZNF786Q8N393 782 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 ZNF525Q8N782 197 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 SLC26A10Q8NG04 563 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 OR5L1Q8NGL2 311 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 C10orf105Q8TEF2 133 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-211ENST00000476336 FN1P02751 2386 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 PLSCR5A0PG75 271 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 OR6C68A6NDL8 312 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 RIIAD1A6NNX1 92 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 H3BN98 237 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 CIB2O75838 187 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 LY6G6DO95868 133 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 ABHD16AO95870 558 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 HLA-DQA2P01906 255 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 SCG5P05408 212 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 GAAP10253 952 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 DAOP14920 347 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 ZNF3P17036 446 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 PAICSP22234 425 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 GIFP27352 417 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 HIST1H3AP68431 136 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 TEKQ02763 1124 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-211ENST00000476336 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms