RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472645.1

TIMM17B-206, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, human

TSL 3

Gene TIMM17B, Length 804 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM17B-206	ENST00000472645		M0R233	179 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645		M0R3G1	203 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	NPIPB7	O75200	414 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	RP2	O75695	350 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	ZNF35	P13682	527 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	FPR3	P25089	353 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	COPZ1	P61923	177 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	LAPTM4A	Q15012	233 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	TREML4	Q6UXN2	200 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	TEX29	Q8N6K0	151 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	ZNF75A	Q96N20	296 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	C12orf10	Q9HB07	376 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	RLIM	Q9NVW2	624 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	SNTN	A6NMZ2	147 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	PLPP2	O43688	288 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	CHP2	O43745	196 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	NCR1	O76036	304 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	CLIC3	O95833	236 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	GKN3P	P0CG01	181 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	HKR1	P10072	659 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	ADRA2C	P18825	462 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	GLRX	P35754	106 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	CLDN17	P56750	224 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	MVK	Q03426	396 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	OR1Q1	Q15612	314 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	ULK3	Q6PHR2	472 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	SYT3	Q9BQG1	590 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	RHCG	Q9UBD6	479 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645		A0A087WUU8	490 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645		A0A0B4J2E0	115 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645		A0A0G2JK05	382 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645		A0A1B0GX12	115 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	SLC1A7	O00341	560 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	FRS3	O43559	492 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	BCL10	O95999	233 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	TFAP2A	P05549	437 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	NAT2	P11245	290 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	GSS	P48637	474 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	FOXL1	Q12952	345 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	SEC23B	Q15437	767 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	COMTD1	Q86VU5	262 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	SVOP	Q8N4V2	548 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	RNF217	Q8TC41	542 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	FZR1	Q9UM11	496 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	RCE1	Q9Y256	329 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645		H3BN98	237 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	TPST2	O60704	377 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	SEC14L2	O76054	403 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	MPZL1	O95297	269 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	HLA-H	P01893	362 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	PNMT	P11086	282 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	ALDH3B2	P48448	385 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	NANP	Q8TBE9	248 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	TMEM239	Q8WW34	195 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	MYDGF	Q969H8	173 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-206	ENST00000472645	DUSP21	Q9H596	190 aa		13.59	□□□□□ -0.23

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