RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ARL9	Q6T311	187 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00471	Q8N535	108 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	OR2T29	Q8NH02	315 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf21	Q9H246	121 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFS8	O00217	210 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	SOX14	O95416	240 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	CST1	P01037	141 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	GAST	P01350	101 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	WNT5A	P41221	380 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	NR4A2	P43354	598 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1CB	P62140	327 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	AQP6	Q13520	282 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	FLOT2	Q14254	428 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	MEP1B	Q16820	701 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	C4orf45	Q96LM5	186 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	PLSCR5	A0PG75	271 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	DHRS12	A0PJE2	317 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	CD5L	O43866	347 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	E2F6	O75461	281 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	TXNDC12	O95881	172 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	RAP2A	P10114	183 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	MAGEA2	P43356	314 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	MOG	Q16653	247 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	SYT9	Q86SS6	491 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	SLC7A6	Q92536	515 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	OTULIN	Q96BN8	352 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	CHID1	Q9BWS9	393 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	DECR2	Q9NUI1	292 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	VNN3	Q9NY84	501 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	B9D1	Q9UPM9	204 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880		H3BN98	237 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	DCTN6	O00399	190 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	CDC14B	O60729	498 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	HPX	P02790	462 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF250	P15622	560 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	MPV17	P39210	176 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	MAGEB1	P43366	347 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	CCL8	P80075	99 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	MICA	Q29983	383 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	CORO6	Q6QEF8	472 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	SNX18	Q96RF0	628 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	12.67	□□□□□ -0.38	1e-6	■■□□□ 14.5
SSR4-208	ENST00000471880		A0A096LNT2	108 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	LRP5L	A4QPB2	252 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	ARPC3	O15145	178 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	RER1	O15258	196 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	SPRY3	O43610	288 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	IDH3B	O43837	385 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	NGF	P01138	241 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF823	P16415	610 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	GSTM3	P21266	225 aa		12.67	□□□□□ -0.38

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