RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467308.1

TSSC4-208, Transcript of tumor suppressing subtransferable candidate 4, human

TSL 3

Gene TSSC4, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSSC4-208	ENST00000467308	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	SAMD8	Q96LT4	415 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF570	Q96NI8	536 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	OCEL1	Q9H607	264 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	RASD1	Q9Y272	281 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308		M0R082	166 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	IMPA2	O14732	288 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	MPZL2	O60487	215 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	VENTX	O95231	258 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	TXNDC12	O95881	172 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	ISL1	P61371	349 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	TEK	Q02763	1124 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	SCGB2A2	Q13296	93 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	PMS2P3	Q13401	168 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	ALG10	Q5BKT4	473 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	IGHM	P01871	453 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	CD14	P08571	375 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	CELA3B	P08861	270 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	ARR3	P36575	388 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	AQP2	P41181	271 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	PUDP	Q08623	228 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	RCE1	Q9Y256	329 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSSC4-208	ENST00000467308	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	MS4A18	H0YCH9	400 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF432	O94892	652 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	ADRA2A	P08913	450 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	EVX1	P49640	407 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	MYBPC1	Q00872	1141 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	FAM122B	Q7Z309	247 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	PXK	Q7Z7A4	578 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	IFT27	Q9BW83	186 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	CMC2	Q9NRP2	79 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	INIP	Q9NRY2	104 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	SURF4	O15260	269 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	OR6A2	O95222	327 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	CLIC3	O95833	236 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	ADORA3	P0DMS8	318 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	GABRB1	P18505	474 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	TMEM186	Q96B77	213 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	CNBD2	Q96M20	576 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	OXGR1	Q96P68	337 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	FN3K	Q9H479	309 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	NOX3	Q9HBY0	568 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	CMAHP	Q9Y471	501 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TSSC4-208	ENST00000467308	RNF13	O43567	381 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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