RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445369.2

CLDN9-201, Transcript of claudin 9, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN9, Length 2,050 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9-201ENST00000445369 RGS19P49795 217 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 DEGS2Q6QHC5 323 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 TMEM205Q6UW68 189 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 TEX261Q6UWH6 196 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 POC1BQ8TC44 478 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 B3GAT1Q9P2W7 334 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 MYOTQ9UBF9 498 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 U3KQ87 197 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 SNRPGP15A8MWD9 76 aa15.92■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 LCN10Q6JVE6 187 aa15.92■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 NHLRC1Q6VVB1 395 aa15.92■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 OR10G3Q8NGC4 313 aa15.92■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 OR51A2Q8NGJ7 313 aa15.92■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 OR13C3Q8NGS6 347 aa15.92■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 RNF133Q8WVZ7 376 aa15.92■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 CRB3Q9BUF7 120 aa15.92■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 SERINC1Q9NRX5 453 aa15.92■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 WIF1Q9Y5W5 379 aa15.92■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 A0A1W2PQ72 361 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 ZFAND5O76080 213 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 PRSS3P35030 304 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 CSRP2Q16527 193 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 GLYATL3Q5SZD4 288 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 FAM69BQ5VUD6 431 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 LRFN4Q6PJG9 635 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 TSSK4Q6SA08 328 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 OR4D10Q8NGI6 311 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 OR6M1Q8NGM8 313 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 SORCS2Q96PQ0 1159 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 CMKLR1Q99788 373 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 ATG5Q9H1Y0 275 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 APMAPQ9HDC9 416 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 B3GNT2Q9NY97 397 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 MGAT4CQ9UBM8 478 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF69Q9UC07 566 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 DOK2O60496 412 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 DNASE1L1P49184 302 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 BIDP55957 195 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 MYBPHQ13203 477 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 CORO6Q6QEF8 472 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 GPX8Q8TED1 209 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 RADILQ96JH8 1075 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 SLC26A1Q9H2B4 701 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 CA10Q9NS85 328 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 PIPOXQ9P0Z9 390 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 SIT1Q9Y3P8 196 aa15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 MEGF11A6BM72 1044 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 LDLRAD4O15165 306 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 OR2J2O76002 312 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 AKAIN1P0CW23 69 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 VSIG10L2P0DP72 767 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 GABRA1P14867 456 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 C19orf57Q0VDD7 668 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 TMEM244Q5VVB8 128 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 PPP1R3BQ86XI6 285 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 LYPD6Q86Y78 171 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 MEIOBQ8N635 442 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF680Q8NEM1 530 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 OR6N1Q8NGY5 312 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 C11orf40Q8WZ69 217 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 SLX1AQ9BQ83 275 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 GINS4Q9BRT9 223 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 EMC6Q9BV81 110 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 METTL7AQ9H8H3 244 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 FSCN3Q9NQT6 498 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 SDHAF3Q9NRP4 125 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 LMX1BO60663 402 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 DKK1O94907 266 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 GIPP09681 153 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 H2BFMP0C1H6 154 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 GTF2F2P13984 249 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF81P51508 661 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 MMP16P51512 607 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 IKZF1Q13422 519 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 FAM109AQ8N4B1 249 aa15.9■□□□□ 0.14
CLDN9-201ENST00000445369 CLEC1AQ8NC01 280 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms