RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 RNF125Q96EQ8 232 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 MBOAT4Q96T53 435 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ATP5SQ99766 215 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ULBP2Q9BZM5 246 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A18Q9H1K4 315 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 POFUT1Q9H488 388 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 PLEKHA2Q9HB19 425 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 DHDHQ9UQ10 334 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 WSB1Q9Y6I7 421 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 MYO10Q9HD67 2058 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 NINQ8N4C6 2090 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ZFP92A6NM28 416 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 GABARAPH6UMI1 98 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 XRCC3O43542 346 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 UMODP07911 640 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ADH4P08319 380 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 LPOP22079 712 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 SSR2P43308 183 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 DNASE1L1P49184 302 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 AGTR2P50052 363 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 DIO3P55073 304 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 GRB2P62993 217 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 FAM189BP81408 668 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 NKPD1Q17RQ9 610 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 C1orf194Q5T5A4 169 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 FAM151AQ8WW52 585 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 LOXL4Q96JB6 756 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ANGPTL4Q9BY76 406 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 HRASLSQ9HDD0 168 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM100Q9NV29 134 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ELOVL5Q9NYP7 299 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 USP22Q9UPT9 525 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 FUT9Q9Y231 359 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 G3V3Y1 287 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 QSOX1O00391 747 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 OR1F1O43749 312 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 CSO75390 466 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 C8AP07357 584 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 TBC1D3HP0C7X1 549 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 FTH1P19P0C7X4 201 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 PSG1P11464 419 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ACKR3P25106 362 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 PXNP49023 591 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 CCR5P51681 352 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 CNN1P51911 297 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 TMPRSS3P57727 454 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 HBA1P69905 142 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ZFAND6Q6FIF0 208 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 PODNL1Q6PEZ8 512 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 MED25Q71SY5 747 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 SGPP2Q8IWX5 399 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 AMER3Q8N944 861 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 SDR9C7Q8NEX9 313 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 OR4C15Q8NGM1 316 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 SYNPRQ8TBG9 265 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 EFCAB11Q9BUY7 163 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 COLEC11Q9BWP8 271 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 BCAS3Q9H6U6 928 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 SGK2Q9HBY8 427 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 Q9N2K0 584 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 C1orf123Q9NWV4 160 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 JKAMPQ9P055 326 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 TNFSF18Q9UNG2 199 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 MYH4Q9Y623 1939 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 NEO1Q92859 1461 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM88BA6NKF7 163 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF716A6NP11 495 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 GPR39O43194 453 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF205O95201 554 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 OPN1SWP03999 348 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 TACSTD2P09758 323 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 OR4Q2P0C623 313 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF735P0CB33 412 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 DRD2P14416 443 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 CRISP2P16562 243 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ATF1P18846 271 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 FCER1GP30273 86 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 FRKP42685 505 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 GALR1P47211 349 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 RPS14P62263 151 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 B4GALNT1Q00973 533 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 MGAT2Q10469 447 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 RAB40BQ12829 278 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF79Q15937 498 aa5.11□□□□□ -1.59
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