RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 CAMK2AQ9UQM7 478 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 ETV7Q9Y603 341 aa8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 ITPR3Q14573 2671 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 HEATR5AQ86XA9 2040 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 AQP7P3A6NL99 342 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 B4DXG7 233 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 C21orf140B9A014 251 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 H3BML4 177 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 K7EM74 188 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 PIN1P1O15428 100 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 PLA2G10O15496 165 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 SULT1B1O43704 296 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 IGHG1P01857 330 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 SERPINA7P05543 415 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 SPARCP09486 303 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 HLA-DOBP13765 273 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 SPNP16150 400 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 ATF1P18846 271 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 DPP4P27487 766 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 MAP2K3P46734 347 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 RFX2P48378 723 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 OR2B6P58173 313 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 OR10A3P58181 314 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 UBE2NLQ5JXB2 153 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 AGAP6Q5VW22 663 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 TIGD3Q6B0B8 471 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM225Q6GV28 225 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 STAC2Q6ZMT1 411 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 TMPPEQ6ZT21 453 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 AKAP14Q86UN6 197 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 UBQLNLQ8IYU4 475 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 OR1J4Q8NGS1 313 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 OR13C5Q8NGS8 318 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 OR52N5Q8NH56 324 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF671Q8TAW3 534 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 ENKURQ8TC29 256 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 RFT1Q96AA3 541 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 AGAP4Q96P64 663 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 WACQ9BTA9 647 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 ABHD6Q9BV23 337 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF160Q9HCG1 818 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 BRD7Q9NPI1 651 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 FBXL2Q9UKC9 423 aa8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 MED13Q9UHV7 2174 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 MEGF11A6BM72 1044 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 CENPXA8MT69 81 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 SULT2B1O00204 365 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 PSMD9O00233 223 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 LYRM1O43325 122 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 P04436 131 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 ISG15P05161 165 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 CD2P06729 351 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF43P17038 809 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 LAP3P28838 519 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 MNDAP41218 407 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 MMP15P51511 669 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 P2RY4P51582 365 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 CAPZA1P52907 286 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 BIDP55957 195 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 MELKQ14680 651 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 POU4F3Q15319 338 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 P2RY14Q15391 338 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 TAB1Q15750 504 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 KCNMB1Q16558 191 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 PLET1Q6UQ28 207 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 CATSPERDQ86XM0 798 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 OR10H5Q8NGA6 315 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 OR4M1Q8NGD0 313 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 PRR7Q8TB68 274 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 CT55Q8WUE5 264 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 MCHR2Q969V1 340 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 IP6K3Q96PC2 410 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 OR5B2Q96R09 309 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 NPAS1Q99742 590 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 PIGQQ9BRB3 760 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 ABCG5Q9H222 651 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 NIPAL2Q9H841 368 aa8.93□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms