RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNRGQ8N5I3 272 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 GJC3Q8NFK1 279 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 SLAMF6Q96DU3 332 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 R4GMQ9 66 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 RAB19A4D1S5 217 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 GLSO94925 669 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 IGHA1P01876 353 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 THSD4Q6ZMP0 1018 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 TMED6Q8WW62 240 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 YIPF5Q969M3 257 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 BANF2Q9H503 90 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 CHST11Q9NPF2 352 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFPL1O95159 310 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ACSM4P0C7M7 580 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC25A1P53007 311 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 OR5M1Q8NGP8 315 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 NAT6Q93015 286 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 RNF32Q9H0A6 362 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 TAAR5O14804 337 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 AKR7A3O95154 331 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 SELENOVP59797 346 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 UBE2KP61086 200 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 HBE1P02100 147 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 CD79AP11912 226 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ALOX5APP20292 161 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 AKR1C1Q04828 323 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 PRAMEF20Q5VT98 475 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 OR10K2Q6IF99 312 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 WDR5BQ86VZ2 330 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 BAP18Q8IXM2 172 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 C3orf49Q96BT1 292 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 COX14Q96I36 57 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 EMC6Q9BV81 110 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ENKD1Q9H0I2 346 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 FANCFQ9NPI8 374 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 KPTNQ9Y664 436 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 PRAMEF25A6NGN4 478 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 TRAPPC2LH3BP13 241 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 IFNA4P05014 189 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 APEHP13798 732 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR85P60893 370 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 DCDP81605 110 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 HTRA3P83110 453 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF266Q14584 549 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF611Q8N823 705 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 TEX19Q8NA77 164 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 B9D1Q9UPM9 204 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 FBXO7Q9Y3I1 522 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 NR0B2Q15466 257 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF74Q16587 644 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF684Q5T5D7 378 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 PRSS42Q7Z5A4 293 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 LGI3Q8N145 548 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 FOXJ3Q9UPW0 622 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 WNK3Q9BYP7 1800 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ICOSLGO75144 302 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ZP3P21754 424 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 PDZK1IP1Q13113 114 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ZIC1Q15915 447 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM240Q5SV17 173 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 NKAIN2Q5VXU1 208 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 LYG2Q86SG7 212 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 NAXDQ8IW45 347 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 SPICQ8N5J4 248 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM229BQ8NBD8 167 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC30A7Q8NEW0 376 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 OR4N2Q8NGD1 307 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 HSD17B8Q92506 261 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 OR8B4Q96RC9 309 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 MTFP1Q9UDX5 166 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 RFPL4AA6NLU0 287 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 MYOGP15173 224 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF44P15621 663 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 PRTGQ2VWP7 1150 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms