RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 FLRT1Q9NZU1 646 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 LYRM1O43325 122 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 OR13C7P0DN81 318 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 GGT1P19440 569 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 PGGT1BP53609 377 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 GABARAPL2P60520 117 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 PAX2Q02962 417 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 IL10RBQ08334 325 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 EIPR1Q53HC9 387 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TPRG1Q6ZUI0 275 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ASCL5Q7RTU5 278 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 GJD3Q8N144 294 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 OR9I1Q8NGQ6 314 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 FNDC9Q8TBE3 224 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 NETO1Q8TDF5 533 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM162AQ96A26 154 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR146Q96CH1 333 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 REEP2Q9BRK0 252 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 NTMQ9P121 344 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 LIPGQ9Y5X9 500 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 V9GYS6 101 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 MCRIP1C9JLW8 97 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD28O15084 1053 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 LDB2O43679 373 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H2BKO60814 126 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H2BJP06899 126 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 PTPRAP18433 802 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H2BOP23527 126 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 FASP25445 335 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H2BBP33778 126 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CD96P40200 585 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 GLP1RP43220 463 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 MAGEA3P43357 314 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF83P51522 516 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H2BDP58876 126 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H2BCP62807 126 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 PSG6Q00889 435 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 MMDQ15546 238 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 PTH2Q96A98 100 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ESAMQ96AP7 390 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 IP6K3Q96PC2 410 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5B12Q96R08 314 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 PKIBQ9C010 78 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 POPDC2Q9HBU9 364 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 Q9N2K0 584 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 GCM1Q9NP62 436 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 JPT1Q9UK76 154 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF6Q9Y252 685 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 LCTP09848 1927 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GVI7 797 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 DLX3O60479 287 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 EGR1P18146 543 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 Q8N402 240 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2T11Q8NH01 316 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 B5MCH6 92 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 G3V4G9 280 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 UPK1AO00322 258 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 RFXANKO14593 260 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ALOX12BO75342 701 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CDS2O95674 445 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB36O95755 333 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 VTNP04004 478 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 GBAP04062 536 aa6.13□□□□□ -1.43
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