RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362776.1

RNU6-1272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1272P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CEACAM3P40198 252 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 EIF1P41567 113 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 YAP1P46937 504 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RABIFP47224 123 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CDKN2DP55273 166 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 AP1B1Q10567 949 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FILIP1LQ4L180 1135 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 YIF1BQ5BJH7 314 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CCNJQ5T5M9 372 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TMPPEQ6ZT21 453 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TMEM123Q8N131 208 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ACTL9Q8TC94 416 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GPR82Q96P67 336 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MARVELD1Q9BSK0 173 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RAB18Q9NP72 206 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC17A7Q9P2U7 560 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RPH3ALQ9UNE2 315 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 AURKCQ9UQB9 309 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SCN4AP35499 1836 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 F8WDY8 70 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 C15orf65H3BRN8 121 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 L7N2F9 121 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FCMRO60667 390 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 OR7A10O76100 309 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CD28P10747 220 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HCAR3P49019 387 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IL5RAQ01344 420 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SS18Q15532 418 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SP6Q3SY56 376 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TCEAL5Q5H9L2 206 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ENPP6Q6UWR7 440 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LIX1Q8N485 282 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 OR11H7Q8NGC8 314 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TCEAL3Q969E4 200 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GALNT14Q96FL9 552 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ABCG5Q9H222 651 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DSN1Q9H410 356 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GABRR3A8MPY1 467 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KRBOX1C9JBD0 128 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CLDN34H7C241 214 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF208O43345 1280 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PLIN3O60664 434 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ERLIN2O94905 339 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FSTL3O95633 263 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 C2P06681 752 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CTSGP08311 255 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 OR5H8P0DN80 308 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CD37P11049 281 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ATF6P18850 670 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CCND2P30279 289 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CA8P35219 290 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HSD17B2P37059 387 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GMFBP60983 142 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 C2orf54Q08AI8 447 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PDZK1IP1Q13113 114 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CHRNA6Q15825 494 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TATDN3Q17R31 274 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DEFB119Q8N690 84 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FADS6Q8N9I5 356 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CNDP1Q96KN2 507 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FAM111AQ96PZ2 611 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC38A2Q96QD8 506 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KCNK16Q96T55 309 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SPXQ9BT56 116 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KCNJ16Q9NPI9 418 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FBXO8Q9NRD0 319 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RHBDL2Q9NX52 303 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IL37Q9NZH6 218 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 THADAQ6YHU6 1953 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 COL6A6A6NMZ7 2263 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 A0A087WZY1 265 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FAM170AA1A519 330 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 OR7C2O60412 319 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DPM1O60762 260 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GLSO94925 669 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MFN2O95140 757 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms