RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 CPEP16870 476 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 TAS2R30P59541 319 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 SHBQ15464 509 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 CALHM3Q86XJ0 350 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 SCPEP1Q9HB40 452 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFB11Q9NX14 153 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 KITLGP21583 273 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 UBA52P62987 128 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 S100A12P80511 92 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 CORO6Q6QEF8 472 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM185AQ8NFB2 350 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ARSGQ96EG1 525 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 TIMD4Q96H15 378 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 HRO43593 1189 aa14.83□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 S100PBPQ96BU1 408 aa14.83□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa14.83□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR173Q9NS66 373 aa14.83□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 TAS2R4Q9NYW5 299 aa14.83□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF225Q9UK10 706 aa14.83□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SERTM1A2A2V5 107 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2W5A6NFC9 320 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 MED6O75586 246 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 LGALS4P56470 323 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 AADACL4Q5VUY2 407 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF547Q8IVP9 402 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 GON7Q9BXV9 100 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 VN1R1Q9GZP7 353 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 A8MXE2 369 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 AGPAT2O15120 278 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 CD160O95971 181 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 KIR2DL3P43628 341 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 HBG1P69891 147 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 HBG2P69892 147 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 DOC2BQ14184 412 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 RDH10Q8IZV5 341 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 OR52N5Q8NH56 324 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 JAM3Q9BX67 310 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA0040Q15053 153 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 RNLSQ5VYX0 342 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 DHRS13Q6UX07 377 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 OR1L3Q8NH93 324 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 HMGCLL1Q8TB92 370 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC22A20A6NK97 555 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 CTXN2P0C2S0 81 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 EDDM3AQ14507 147 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SMIM19Q96E16 107 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 GABARAPH6UMI1 98 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PMS2P2O95744 297 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 HEXAP06865 529 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4A16Q8NH70 328 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGDIGQ99819 225 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A087WUJ7 227 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 M0QYG6 137 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 IMPA2O14732 288 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ENSAO43768 121 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB4BP61018 213 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 MDGA2Q7Z553 956 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 LACC1Q8IV20 430 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR84Q9NQS5 396 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM64CA6NLI5 447 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TUSC2O75896 110 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 IL9P15248 144 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ABCD3P28288 659 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 CDK5R1Q15078 307 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 KRBOX4Q5JUW0 171 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM173AQ9BQD7 235 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 R4GMQ9 66 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD61A6NGH8 418 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 DUSP2Q05923 314 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PLA2G7Q13093 441 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PEA15Q15121 130 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 OGFOD3Q6PK18 319 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 OR5AS1Q8N127 324 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 LGI3Q8N145 548 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SIGLEC11Q96RL6 698 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 MFRPQ9BY79 579 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 BANF2Q9H503 90 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SCN1AP35498 2009 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 OR6C6A6NF89 314 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 K7EQS6 105 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 EGFL6Q8IUX8 553 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4D9Q8NGE8 314 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 OR51F2Q8NH61 342 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM43Q9BTV4 400 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms